複合體Ⅲ(UQH2-細胞色素c氧化還原酶或細胞色素b和細胞色素c1)含有近10個多肽(其中1個由線粒體基因編碼),包括細胞色素b和細胞色素c1,以及1個鐵-硫中心。複合體Ⅲ把電子從還原型泛醒(UQH2)傳遞給細胞色素c,並且每傳遞一對電子,同時傳遞4個質子到膜間隙。
線粒體作為真核細胞的重要“能量工廠”,是細胞進行呼吸作用的場所。線粒體呼吸鏈(又稱氧化磷酸化電子傳遞鏈)位於線粒體內膜上,由四個相對分子質量很大的跨膜蛋白複合體(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、和Ⅳ)、介於Ⅰ/Ⅱ與Ⅲ之間的泛醌以及介於Ⅲ與Ⅳ之間的細胞色素c共同組成。線粒體呼吸鏈的功能是進行生物氧化,並與稱之為複合體V的ATP合成酶相偶聯,共同完成氧化磷酸化過程,並生產能量分子ATP。琥珀酸-細胞色素c氧化還原酶(SCR)是由複合體Ⅱ和複合體Ⅲ所組成。