藻類DNA病毒科

藻類DNA病毒科（phycodnaviridae），是一種寄生於藻類的DNA病毒。

1991年，小球藻病毒正式命名為藻類DNA病毒科。

基本介紹

• 中文名：藻類DNA病毒科
• 外文名：Phycodnaviridae
• 分類類型：科
• 分類：藻類DNA病毒科

藻類DNA病毒科成員

屬 種 綠藻病毒屬（Chlorovirus） 綠藻病毒屬（Chlorovirus） 小球藻病毒1型（Paramecium bursaria Chlorella virus 1） 小球藻病毒AL1A型（Paramecium bursaria Chlorella virus AL1A） 小球藻病毒AL2A型（Paramecium bursaria Chlorella virus AL2A） 小球藻病毒BJ2C型（Paramecium bursaria Chlorella virus BJ2C） 小球藻病毒CA4A型（Paramecium bursaria Chlorella virus CA4A） 小球藻病毒CA4B型（Paramecium bursaria Chlorella virus CA4B） 小球藻病毒IL3A型（Paramecium bursaria Chlorella virus IL3A） 小球藻病毒NC1A型（Paramecium bursaria Chlorella virus NC1A） 小球藻病毒NE8A型（Paramecium bursaria Chlorella virus NE8A） 小球藻病毒NY2A型（Paramecium bursaria Chlorella virus NY2A） 小球藻病毒Nys1型（Paramecium bursaria Chlorella virus NYs1） 小球藻病毒SC1A型（Paramecium bursaria Chlorella virus SC1A） 小球藻病毒XY6E型（Paramecium bursaria Chlorella virus XY6E） 小球藻病毒X23A型（Paramecium bursaria Chlorella virus XZ3A） 小球藻病毒X24A型（Paramecium bursaria Chlorella virus XZ4A） 小球藻病毒X24C型（Paramecium bursaria Chlorella virus XZ4C） 小球藻病毒AI型（Paramecium bursaria Chlorella virus A1） 水螅綠藻病毒1型（Hydra viridis Chlorella virus 1） 小球藻病毒AL2C型（Paramecium bursaria Chlorella virus AL2C） 小球藻病毒CA1A型（Paramecium bursaria Chlorella virus CA1A） 小球藻病毒CA1D型（Paramecium bursaria Chlorella virus CA1D） 小球藻病毒CA2A型（Paramecium bursaria Chlorella virus CA2A） 小球藻病毒IL2A型（Paramecium bursaria Chlorella virus IL2A） 小球藻病毒IL2B型（Paramecium bursaria Chlorella virus IL2B） 小球藻病毒IL3D型（Paramecium bursaria Chlorella virus IL3D） 小球藻病毒IL5-2s1型（Paramecium bursaria Chlorella virus IL5-2s1） 小球藻病毒MAID型（Paramecium bursaria Chlorella virus MA1D） 小球藻病毒MA1E型（Paramecium bursaria Chlorella virus MA1E） 小球藻病毒NC1B型（Paramecium bursaria Chlorella virus NC1B） 小球藻病毒NC1C型（Paramecium bursaria Chlorella virus NC1C） 小球藻病毒NC1D型（Paramecium bursaria Chlorella virus NC1D） 小球藻病毒NE8D型（Paramecium bursaria Chlorella virus NE8D） 小球藻病毒NY2B型（Paramecium bursaria Chlorella virus NY2B） 小球藻病毒NY2C型（Paramecium bursaria Chlorella virus NY2C） 小球藻病毒NY2F型（Paramecium bursaria Chlorella virus NY2F） 小球藻病毒Nyb1型（Paramecium bursaria Chlorella virus NYb1） 小球藻病毒SC1B型（Paramecium bursaria Chlorella virus SC1B） 小球藻病毒SH6A型（Paramecium bursaria Chlorella virus SH6A） 小球藻病毒XZ26C型（Paramecium bursaria Chlorella virus XZ5C） 小球藻病毒CVBII型（Paramecium bursaria Chlorella virus CVBII） 小球藻病毒CVK2型（Paramecium bursaria Chlorella virus CVK2） 小球藻病毒CVUI型（Paramecium bursaria Chlorella virus CVU1） 小球藻病毒BI型（Paramecium bursaria Chlorella virus B1） 小球藻病毒GI型（Paramecium bursaria Chlorella virus G1） 小球藻病毒MI型（Paramecium bursaria Chlorella virus M1） 小球藻病毒RI型（Paramecium bursaria Chlorella virus R1） 水螅綠藻病毒2型（Hydra viridis Chlorella virus 2） 水螅綠藻病毒3型（Hydra viridis Chlorella virus 3） 青綠藻病毒屬（Prasinovirus） 細小微單胞藻病毒SP1（Micromonas pusilla virus SP1） 細小微單胞藻病毒SP2（Micromonas pusilla virus SP2） 細小微單胞藻病毒GM1（Micromonas pusilla virus GM1） 細小微單胞藻病毒PB8（Micromonas pusilla virus PB8） 細小微單胞藻病毒SG1（Micromonas pusilla virus SG1） 細小微單胞藻病毒PB7（Micromonas pusilla virus PB7） 細小微單胞藻病毒PB6（Micromonas pusilla virus PB6） 細小微單胞藻病毒PL1（Micromonas pusilla virus PL1） 定鞭藻病毒屬（Prymnesiovirus） 短絲金藻病毒PWI（Chysochromulina brevifilum virus PW1） 短絲金藻病毒PW3（Chysochromulina brevifilum virus PW3） 球形棕囊藻病毒-01T型（Phaeocystis globosa virus 1（Texel）） 球形棕囊藻病毒-02T型（Phaeocystis globosa virus 2（Texel）） 球形棕囊藻病毒-03T型（Phaeocystis globosa virus 3（Texel）） 球形棕囊藻病毒-04T型（Phaeocystis globosa virus 4（Texel）） 球形棕囊藻病毒-05T型（Phaeocystis globosa virus 5（Texel）） 球形棕囊藻病毒-06T型（Phaeocystis globosa virus 6（Texel）） 球形棕囊藻病毒-07T型（Phaeocystis globosa virus 7（Texel）） 球形棕囊藻病毒-08T型（Phaeocystis globosa virus 8（Texel）） 球形棕囊藻病毒-09T型（Phaeocystis globosa virus 9（Texel）） 球形棕囊藻病毒-10T型（Phaeocystis globosa virus 10（Texel）） 球形棕囊藻病毒-11T型（Phaeocystis globosa virus 11（Texel）） 球形棕囊藻病毒-12T型（Phaeocystis globosa virus 12（Texel）） 球形棕囊藻病毒-13T型（Phaeocystis globosa virus 13（Texel）） 球形棕囊藻病毒-14T型（Phaeocystis globosa virus 14（Texel）） 球形棕囊藻病毒-15T型（Phaeocystis globosa virus 15（Texel）） 球形棕囊藻病毒-16T型（Phaeocystis globosa virus 16（Texel）） 球形棕囊藻病毒-17T型（Phaeocystis globosa virus 17（Texel）） 球形棕囊藻病毒-18T型（Phaeocystis globosa virus 18（Texel）） 球形棕囊藻病毒-102P型（Phaeocystis globosa virus 102（Polmouth）） 褐藻病毒屬（Phaeovirus） 束生水雲褐藻病毒a型（Ectocarpus fasciculatus virus a） 長囊水雲褐藻病毒I型（Ectocarpus siliculosus virus 1） 長囊水雲褐藻病毒a型（Ectocarpus siliculosus virus a） 異費氏褐藻病毒a型（Feldmannia irregularis virus a） 費氏褐藻病毒（Feldmannia species virus） 費氏褐藻病毒a型（Feldmannia species virus a） 痕克褐藻病毒a型（Hincksia hinckiae virus a） 多毛褐藻病毒a型（Myriotrichia clavaeformis virus a） 海濱球螺藻病毒a（Pilayella littoralis virus a） 球石藻病毒屬（Coccoliithovirus） 赫胥黎艾氏藻病毒86（Emiliania huxley virus 86） 赫胥黎艾氏藻病毒163（Emiliania huxley virus 163） 赫胥黎艾氏藻病毒201（Emiliania huxley virus 201） 赫胥黎艾氏藻病毒202（Emiliania huxley virus 202） 赫胥黎艾氏藻病毒203（Emiliania huxley virus 203） 赫胥黎艾氏藻病毒205（Emiliania huxley virus 205） 赫胥黎艾氏藻病毒207（Emiliania huxley virus 207） 赫胥黎艾氏藻病毒208（Emiliania huxley virus 208） 赫胥黎艾氏藻病毒2KB1（Emiliania huxley virus 2KB1） 赫胥黎艾氏藻病毒2KB2（Emiliania huxley virus 2KB2） 赫胥黎艾氏藻病毒84（Emiliania huxley virus 84） 赫胥黎艾氏藻病毒88（Emiliania huxley virus 88） 赫胥黎艾氏藻病毒99B1（Emiliania huxley virus 99B1） 針胞藻病毒屬（Raphidovirus） 赤潮異彎藻病毒01型（Heterosigma akashiwo virus 01） 赤潮異彎藻病毒02型（Heterosigma akashiwo virus 02） 赤潮異彎藻病毒03型（Heterosigma akashiwo virus 03） 赤潮異彎藻病毒04型（Heterosigma akashiwo virus 04） 赤潮異彎藻病毒05型（Heterosigma akashiwo virus 05） 赤潮異彎藻病毒06型（Heterosigma akashiwo virus 06） 赤潮異彎藻病毒07型（Heterosigma akashiwo virus 07） 赤潮異彎藻病毒08型（Heterosigma akashiwo virus 08） 赤潮異彎藻病毒09型（Heterosigma akashiwo virus 09） 赤潮異彎藻病毒10型（Heterosigma akashiwo virus 10） 赤潮異彎藻病毒11型（Heterosigma akashiwo virus 11） 赤潮異彎藻病毒12型（Heterosigma akashiwo virus 12） 赤潮異彎藻病毒13型（Heterosigma akashiwo virus 13） 赤潮異彎藻病毒14型（Heterosigma akashiwo virus 14） 赤潮異彎藻病毒15型（Heterosigma akashiwo virus 15） - 金球藻病毒（Aureococcus anophagefference virus ） - 金色藻病毒01B型（Chrysochromulina ericina virus 01B） - 赤潮甲藻病毒01型（Heterocapsa circularisquama virus 01） - 赤潮甲藻病毒02型（Heterocapsa circularisquama virus 02） - 赤潮甲藻病毒03型（Heterocapsa circularisquama virus 03） - 赤潮甲藻病毒04型（Heterocapsa circularisquama virus 04） - 赤潮甲藻病毒05型（Heterocapsa circularisquama virus 05） - 赤潮甲藻病毒06型（Heterocapsa circularisquama virus 06） - 赤潮甲藻病毒07型（Heterocapsa circularisquama virus 07） - 赤潮甲藻病毒08型（Heterocapsa circularisquama virus 08） - 赤潮甲藻病毒09型（Heterocapsa circularisquama virus 09） - 赤潮甲藻病毒10型（Heterocapsa circularisquama virus 10） - 棕囊藻病毒01型（Phaeocystis pouchetii virus 01） - 塔胞藻病毒01B型（Pyramimonas orientalis virus 01B）

藻類DNA病毒科病毒形態學特性

病毒粒子均為多角體粒子，粒子是由一個電子密度緻密的核以及包裹多層蛋白外殼組成。病毒粒子的外層並不存在一層膜，殼體的直徑在130-190nm之間，一些電子顯微鏡照片顯示，病毒粒子在其腫脹結構的末端有著頭髮一樣的附屬物，這些附屬物至少存在於病毒粒子的一些頂端，每個病毒粒子含有20-25nm的突起結構。

藻類DNA病毒科病毒生理化學和物理性質

綠藻病毒屬的代表種PBCV-1的分子量為1×109Da，S20W 約高於2000S。當CsCl密度梯度離心時，綠藻病毒屬的成員的病毒粒子會被破壞。綠藻病毒屬病毒粒子的感染性不被非離子去污劑破壞，但有機溶劑能使其失活。

藻類DNA病毒科病毒的核酸

真核藻類病毒粒子具有很大的dsDNA基因組，其範圍為160-380kbp，綠藻病毒屬的具有線性的，不交叉的dsDNA基因組，其末端是交叉的髮夾結構。DNA的末端，都包含相同的1-2.2kbp長度的重複，剩餘的基因組大都是單拷貝的的DNA，褐藻病毒屬成員的基因組是環形dsDNA，並且其中的一些成員包含延伸了的單鏈區域。褐藻病毒屬成員的基因組可以整合入宿主的基因組，病毒粒子的G+C%含量為40-52%，幾乎所有成員的DNA都有甲基化的鹼基，基本上都在胞嘧啶5位的C和腺嘌呤6位的N上。綠藻病毒屬的成員的鹼基甲基化的比例從不含6mA和0.1%5mC到37%的6mA和47%的5mC。

藻類DNA病毒科病毒的蛋白質

純化了的病毒粒子至少包含50種或更多種類的蛋白質，其分子量的範圍大約為10-20×103Da，綠藻病毒屬的代表中PBCV-1具有三種糖蛋白，三種肉豆蔻醯化蛋白（主要的衣殼蛋白Vp54，同時被糖基化和肉豆蔻醯化），一些磷酸化的蛋白質。四種蛋白質，包括Vp54，都定位於病毒粒子的表面。

藻類DNA病毒科病毒的脂類

綠藻病毒屬病毒粒子的5-10%的重量由脂類組成，脂類的成分一般位於糖蛋白殼體的內部，而且對於病毒的感染性是必需的。 6.

藻類DNA病毒科病毒的碳水化合物

綠藻病毒屬PBCV-1至少有三種蛋白質被糖基化，包括主要的外殼蛋白Vp54。Vp54被糖基化的部分位於病毒粒子的外表面。不像其他未知病毒，PBCV-1好像至少編碼一些糖基化的酶。

基因組結構和基因組的複製

綠藻病毒屬PBCV-1的的基因組的序列已經被測定，基因組的大小為333.747kb，此病毒共編碼701個開放型閱讀框，據預測，其中的376個開放型閱讀框編碼的是蛋白質。大約有40%的開放型閱讀框在資料庫中能找到相對應的蛋白質。PBCV-1的兩個基因中有內含子插入：一個像基因一樣的轉錄因子具有自我剪接Ⅰ型的內含子，另一個為DNA聚合酶基因剪接體型的內含子。PBCV-1同樣也編碼10個tRNA基因，其中的一個含有小的內含子。細胞內的病毒DNA複製的情況還不清楚，DNA的包裝出現在細胞質內的特定區域，病毒的轉錄可能出現在細胞核內，因為PBCV-1並不編碼明顯的DNA指導的RNA聚合酶。

藻類DNA病毒科病毒的宿主範圍和傳播途徑

藻類DNA病毒科根據其感染淡水藻類或海藻的不同，可分別在遍布世界各地的淡水或海水中收集到。病毒具宿主專一性，只感染藻類的單一分離株。例如，綠藻病毒屬成員僅吸附單細胞、真核類小球藻屬綠藻的細胞壁，細胞壁在吸附點溶解，病毒DNA和相關病毒蛋白進入細胞，空病毒衣殼留在細胞表面。開始感染後2-4小時，病毒粒子在細胞質中裝配。病毒釋放前30-40分鐘，感染細胞中可檢測到感染性病毒粒子，病毒通過細胞裂解釋放。

細小微胞寄生藻病毒屬成員感染時，病毒吸附在無細胞壁的宿主細胞表面，接近的病毒和細胞表面融合，釋放核心物質後病毒衣殼留在宿主細胞表面，從吸附階段起，侵入過程大約需3小時，病毒一個生長循環需要14小時。在複製循環中，病毒顆粒在細胞質中出現，與健康細胞中缺乏的細胞質絲（直徑5-8nm）及膜結合空泡串相關聯。病毒粒子釋放進入位於細胞膜斷裂的介質，斷裂通常在同一細胞的幾個位置出現。