蔡浩洋，男，蘇黎世大學博士，四川大學生命科學學院副研究員。
基本介紹
- 中文名：蔡浩洋
- 國籍：中國
- 畢業院校：蘇黎世大學
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：生物信息學，腫瘤基因組學
- 職稱：副研究員
人物經歷,研究方向,發表論文,
人物經歷
2014.09 – 至今 四川大學，生命科學學院，副研究員
2013.08 – 2014.07 蘇黎世大學，瑞士生物信息研究所，博士後
2009.09 – 2013.07 蘇黎世大學，分子生物學研究所，博士
2006.09 – 2009.06 四川大學，生命科學學院，理學碩士
2005.09 – 2007.12 電子科技大學，軟體學院，工程碩士
1998.09 – 2002.06 西華大學，計算機學院，本科
研究方向
1.腫瘤基因組生物信息學。研究染色體的重組與突變，鑑定不同類型癌症的驅動基因，揭示其在腫瘤形成過程中的作用，促進癌症的亞型分類、早期診斷及臨床結果的預測。
2.生物醫學大數據的整合與挖掘。分析並整合來自多個組學的數據，開展不同組學間的關聯研究，包括基因組學、轉錄組學、表觀組學、代謝組學等，對癌症的發生、發展和治療提供更全面的認識。
3.生物學資料庫構建。處理並存儲海量生物信息數據，設計線上統計分析及可視化工具，提供資源共享和數據管理平台。
發表論文
1.Cai H*, Gupta S, Rath P, Ai N, Baudis M. arrayMap 2014: An updated cancer genome resource.Nucleic Acids Res.(in press)
2.Cai H, Kumar N, Bagheri H, von Mering C, Robinson MD, Baudis M. Chromothripsis-like patterns are recurring but heterogeneously distributed features in a survey of 22,347 cancer genome srceens.BMC Genomics.2014 Jan 29;15(1):82
3.Cai H*, Kumar N, Ai N, Gupta S, Rath P, Baudis M. Progenetix: 12 years of oncogenomic data curation.Nucleic Acids Res.2014 Jan 1;42(1):D1055-62
4.Cai H, Kumar N, Baudis M. arrayMap: a reference resource for genomic copy number imbalances in human malignancies.PLoS One. 2012;7(5):e36944
5. Kumar N,Cai H, von Mering C, Baudis M. Specific genomic regions are differentially affected by copy number alterations across distinct cancer types, in aggregated cytogenetic data.PLoS One. 2012;7(8):e43689
6. von Bueren AO, Gerss J, Hagel C,Cai H, Remke M, Hasselblatt M, Feuerstein BG, Pernet S, Delattre O, Korshunov A, Rutkowski S, Pfister SM, Baudis M. DNA copy number alterations in central primitive neuroectodermal tumors and tumors of the pineal region: an international individual patient data meta-analysis.J Neurooncol. 2012 Sep;109(2):415-23
7. Baudis M, Giefing M,Cai H, Kumar N, Vater I, Richter J, Siebert R. Array-basierter Nachweis chromosomaler Aberrationen bei malignen Neoplasien.Medizinische Genetik. 2012;24(2):114-122
8. Kumar N, Rehrauer H,Cai H, Baudis M. CDCOCA: a statistical method to define complexity dependence of co-occuring chromosomal aberrations.BMC Med Genomics. 2011 Mar 3;4:21
9. Li X,Cai H, Xu J, Ying S, Zhang Y. A mouse protein interactome through combined literature mining with multiple sources of interaction evidence.Amino Acids. 2010 Apr;38(4):1237-52
10. Li X, Ren Q, Weng Y,Cai H, Zhu Y, Zhang Y. SCGPred: a score-based method for gene structure prediction by combining multiple sources of evidence.Genomics Proteomics Bioinformatics. 2008 Dec; 6(3-4):175-85
