華潤三九醫藥股份有限公司（簡稱“華潤三九”）是大型國有控股醫藥上市公司，前身為深圳南方製藥廠。1999年4月21日，發起設立股份制公司。2000年3月9日在深圳證券交易所掛牌上市，股票代碼000999。公司於2007年11月底正式進入華潤集團。2010年2月，公司名稱由“三九醫藥股份有限公司”正式變更為"華潤三九醫藥股份有限公司"。
基本介紹
- 公司名稱：華潤三九醫藥股份有限公司
- 成立時間：2000年3月9日
- 經營範圍：醫藥產品的研發、生產、銷售及相關健康服務
- 公司性質：國有企業
- 簡稱：華潤三九
- 前身：深圳南方製藥廠
現狀介紹,基本資料,業務範圍,公司成立,股東變化,工業園,主要榮譽,大事記,2000年前,2000年後,地址,
現狀介紹
基本資料
華潤三九主要從事醫藥產品的研發、生產、銷售及相關健康服務。
隨著華潤集團對醫藥行業（戰略業務單元：華潤醫藥集團有限公司）的梳理與併購，華潤三九不斷有新的品種加入。2013年上半年來看，現有產品較豐富，OTC業務覆蓋了感冒用藥、皮膚用藥、胃腸用藥等近10個子領域。處方藥品種覆蓋了抗腫瘤及心血管等治療領域。公司擁有年銷售額過億元的品種13個，其中，999感冒靈系列銷量連續五年位居感冒藥市場第一；三九胃泰和999皮炎平也分別位居OTC胃藥和皮膚藥的前列；止咳化痰品類中999強力枇杷露在2012年度非處方藥產品排名情況統計的中成藥類別的感冒咳嗽類中居第5位。
“999”品牌是中國馳名商標。是中國人心目中的知名品牌，其產品市場占有率也較高。
2012年，華潤三九實現營業收入68.91億元，實現歸屬於母公司所有者的淨利潤（歸屬於上市公司股東的淨利潤）10.14億元，經營活動產生的現金流量淨額12.12億元。截至2012年底，公司總資產為86億元。
與之對應的是：
公司LOGO
公司LOGO當前，華潤三九總市值為180億元，穩定保持在醫藥行業上市公司前列。上市公司及所屬多家生產製造單元為國家高新技術企業。華潤三九先後獲評“2008年度中國上市公司百強金牛獎” 、“2008年度中國上市公司價值百強” 、2009年中國製藥工業百強” 、“2010年度中國最具競爭力醫藥上市公司20強”等榮譽。2011年，在中國中藥協會發布首批中藥行業信用評價結果，華潤三九獲評AAA級中藥企業信用榮譽，榮列排行榜榜首。
經過20多年不懈努力，尤其是2007年併入華潤集團以來，華潤三九逐步發展成為國內大型醫藥類上市公司。
2012年，由世界第二大傳播服務集團WPP發布的《2012中國最具價值品牌TOP50強榜單》中，“999”品牌再度入選其中。此次共有“999” 、雲南白藥、同仁堂3個醫藥品牌入選。
位於深圳市寶安區觀瀾高新技術產業園區內的“華潤三九醫藥工業園”，於2008年5月8日正式建成投產，一期工程占地11萬平方米，建有顆粒劑、乳膏劑、丸劑等多個生產車間和全自動化高架立體倉庫。2012年，二期工程全部建成，華潤三九總部及研發事業部、銷售公司等多個部門由原北環大道北側，搬至觀瀾基地（工業園區內）。
華潤三九完善董事會構成，董事會核心作用逐步強化。公司董事會成員中已設立獨立董事、外部董事。
董事會設立了審計委員會和薪酬與考核委員會，並正在設立“戰略與投資委員會”。專業委員會在員工中長期激勵、內部審計工作的開展等方面發揮了積極作用；公司董事會將日常經營管理許可權授予經理層，對於投資等重大事項則由董事會或股東大會進行決策，充分發揮董事會在經營決策中的核心職能。
2009年6月，華潤三九啟動風險管理項目，對公司及下屬企業關鍵業務流程的風險管理（內控）體系進行全面梳理，對公司風險進行排查與防控。公司通過構建全面風險管理體系，進一步提高公司規範治理水平。
華潤三九引入6S戰略管理體系，不斷完善預算管理，制定了全面預算管理體系，以戰略為導向、業務戰略為基礎，對經營、資本支出、財務等預算進行全面管理，較好的控制了成本，提高了資金使用效率。
為了進一步提升企業的核心競爭力，華潤三九不斷聚集主業。
一是做減法。華潤三九戰略定位清晰後，進一步聚焦主業，自2008年起，先後剝離了房地產、食品、醫藥分銷、零售等非主營業務；
二是做加法。通過外延式併購不斷提高主業份額，先後收購了黃石、南昌、淮北等地的醫藥企業；2011年在集團推動下，整合了北藥集團的天然藥事業部。公司醫藥製造業務在營業收入構成的比例從2008年的57%提高到2011年的86%。2011年5月6日，華潤三九醫藥股份有限公司與中國中醫科學院在北京簽署了合作意向書，雙方就共建產業化生產基地和共同合作興建醫療機構達成合作意向：由華潤三九整合北京華神製藥有限公司和中國中醫科學院實驗藥廠，在北京新設公司，華潤三九擬出資1.5億元以上，持有新公司55%股權，華潤三九出資主要用於在大興工業園區興建產業化生產基地。
2011－2015年的戰略規劃提示：決心通過五年的努力，成為OTC市場的引領者、中藥處方藥市場的創新者，市場份額躋身中國製藥行業前列。
華潤三九的使命、願景及核心價值觀：公司倡導“關愛、責任、卓越”的企業核心價值觀，關愛大眾健康，履行社會責任，追求卓越績效，專注藥品製造，打造信賴品牌，把華潤三九建設成股東價值和員工價值最大化的上市公司。
公司系根據中華人民共和國有關法律的規定，於1999年3月2日經原國家經濟貿易管理委員會國經貿企改[1999]134號檔案批准，由深圳三九藥業有限公司、三九企業集團（深圳南方製藥廠)、深圳九先生物工程有限公司、深圳市先達明物業管理有限公司和惠州市壬星工貿有限公司作為發起人，以發起方式設立的股份有限公司。 本公司經中國證券監督管理委員會以證監發行字[1999]142號文批准,於1999年11月發行人民幣普通股20,000萬股，並於2000年3月9日在深圳證券交易所正式上市交易。 2009 年，公司中文名稱由“三九醫藥股份有限公司”變更為“華潤三九醫藥股份有限公司”；英文名稱由“Sanjiu Medical & Pharmaceutical Co., Ltd.”變更為“China Resources Sanjiu Medical & Pharmaceutical Co., Ltd.”。股票簡稱由“三九醫藥”變更為“華潤三九”。 2010 年2 月11 日，經深圳市市場監督管理局核准，公司名稱正式變更為“華潤三九醫藥股份有限公司”。 經公司申請，並經深圳證券交易所核准，自2010 年2 月24 日起，公司證券簡稱由“三九醫藥”變更為“華潤三九”；英文簡稱變更為“CR Sanjiu”。
業務範圍
公司上市時經營範圍為：藥品、保健品、醫療器械的開發、生產、銷售；相關技術開發、轉讓、服務；醫療、保健服務。
2001年，經公司2001年第一次臨時股東大會審議通過，公司經營範圍變更為：藥品的開發、生產、銷售；相關技術開發、轉讓、服務；生產所需的機械設備和原材料的進口業務；自產產品的出口（國家限定公司經營或禁止進出口的商品及技術除外）。
外觀
外觀通俗點講，主要從事醫藥產品的研發、生產、銷售及相關健康服務。公司以OTC（非處方藥）、中藥處方藥、免煎中藥、抗生素及普藥為四大製藥業務模組，輔以包裝印刷、醫療服務等相關業務。
公司成立
三九醫藥股份有限公司系根據中華人民共和國有關法律的規定，於1999 年3 月2 日經原國家經濟貿易管理委員會國經貿企改[1999]134號檔案批准，由深圳三九藥業有限公司(以下簡稱“三九藥業”)為主要發起人、三九企業集團(深圳南方製藥廠)(以下簡稱“三九集團”)、深圳九先生物工程有限公司、深圳市先達明物業管理有限公司和惠州市壬星工貿有限公司作為發起人，以發起方式設立的股份有限公司。
並於1999年4月21日在國家工商行政管理局註冊登記,領取企業法人營業執照。本公司成立時註冊資本為人民幣55,300 萬元。 本公司經中國證券監督管理委員會以證監發行字[1999]142 號文批准,於1999年11月發行人民幣普通股20,000 萬股,並於2000 年3 月9 日在深圳證券交易所正式上市交易,發行後本公司註冊資本為人民幣75,300 萬元。 本公司於2003 年6 月11 日實施2002 年度股東大會審議通過的用資本公積金每10股轉增3 股的方案,註冊資本增加了人民幣22,590 萬元。
截止2007 年12 月31 日,本公司總股本97,890萬股,但增資的工商登記變更手續尚未辦理完畢。 本公司設立了股東大會、董事會和監事會。
股東變化
公司上市時，深圳三九藥業有限公司持有公司62.72%的股份，為公司控股股東。
2008 年4月16日、2008年6月16日國務院國有資產監督管理委員會、商務部分別批准將三九企業集團所持有的本公司84,462,520股國有法人股股份及深圳三九藥業有限公司所持有的本公司613,937,480股國有法人股股份的持股主體統一變更為新三九控股有限公司(現已更名為華潤醫藥控股有限公司)。
2008年11月27日，公司控股股東變更為華潤醫藥控股有限公司。
工業園
華潤三九醫藥工業園：位於深圳市寶安區觀瀾高新技術產業園區內，於2008年5月8日正式建成投產位，一期占地11萬平方米，建有顆粒劑、乳膏劑、丸劑等多個現代化生產車間和全自動化高架立體倉庫，集研發、生產及物流配送為一體，是國內大型的中藥產業基地。
華潤三九醫藥工業園的建成，全方位推進了上市公司中藥現代化改造、新產品開發、生產能力擴大、產品質量提升。二期工程已於2012年完工，公司的其他相關醫藥生產及配套設施全部遷入。現辦公地點也由深圳市福田區遷至深圳市龍華新區。
面向未來，華潤三九確立了發展戰略，即以品牌OTC為核心業務，以中藥處方藥、免煎中藥為快速增長的重點業務，整合抗生素及普藥業務，進入第三終端。在發展大品種的基礎上，通過對外併購、購買、開發等途徑，不斷豐富產品種類，逐步實施品類規劃，擴大業務規模。以品牌運作和渠道掌控能力為核心優勢，加大研發投入和技術改造，提升產品功能和質量，形成以行銷帶動研發和生產的持續增長的價值創造體系。
為了確保戰略目標的實現，公司正在建立以業務模組為分析和管理單元，行銷、生產、研發、資金管理和品牌管理高度集中的運營體系。
主要榮譽
金牛百強榮登 “金牛百強”、“價值百強”榜
2009 年6 月，在《中國證券報》主辦的“第11 屆中國上市公司百強金牛獎”、《證券時報》主辦
的“2008 年度中國上市公司價值評選”活動中，公司榮登2008 年度中國上市公司“金牛百強”、價值
百強”榜。上述獎項的取得，體現出社會各界對華潤三九業績表現的充分肯定。
調入滬深300指數、深證100成份指數
2006 年至2008 年，公司經營業績持續實現大幅度增長，受到了資本市場的高度認可。自2009 年
7 月1 日起，公司（000999）調入滬深300 指數、深證100 成份指數，併入選了滬深300 相對成長指數、
滬深300 相對價值指數、滬深300 醫藥衛生指數以及中證中盤200 指數。
榮獲“中國最具競爭力醫藥上市公司20 強”
2009 年7 月，在由中國醫藥企業管理協會《醫藥經理人》雜誌社主辦的“首屆中國最具競爭力醫
藥上市公司20 強” 評選活動中，公司入選“中國最具競爭力醫藥上市公司20 強”，公司近3 年的銷
售增長、利潤增長、淨資產收益率、利潤絕對值等多項指標值，在該次活動參選的100 余家醫藥企業
中處於領先地位。
大事記
2000年前
●1984年大事記
6月，趙新先同志帶著500萬元貸款和“三九胃泰”等三個科研成果籌建南方藥廠。
12月，徐向前元帥為南方藥廠題寫廠名“南方藥廠”
●1986年大事記
2月，由趙新先同志親自參與設計的國內第一條中藥自動化提取濃縮生產線NF-A線安裝投產。
●1987年大事記
1月1日，深圳南方製藥廠正式投產，當年實現產值1100萬元，利稅178萬元，利潤165萬元。
3月30日，“999”商標經國家工商局、國家商標局核准註冊。
●1988年大事記
1月，第一軍醫大學為南方藥廠記集體三等功一次。
11月2日，時任中央軍委委員、總後勤部部長的趙南啟上將視察南方藥廠，稱讚南方藥廠在全軍企業中創造了四個第一：“艱苦奮鬥第一，發展速度第一、經濟效益第一、管理機制第一”。
●1989年大事記
4月，解放軍總後勤部為深圳南方製藥廠記“集體二等功”一次。
9月，深圳南方製藥廠銷售收入突破億元大關。
10月1日，趙新先同志出席全國勞動模範和全國先進工作者表彰大會。
●1990年大事記
12月12日，趙新先同志榮獲全國第二屆“科技事業實業家創業獎”金獎。
●1991年大事記
6月，時任中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席的江澤民會見“全國勞動模範和優秀企業家表彰大會”代表，與趙新先同志親切握手。
6月，深圳南方製藥廠進入全國500家大型工業企業行列。
●1992年大事記
9月25日，時任國務院副總理的朱鎔基視察南方藥廠。
●1993年大事記
1月，解放軍總後勤部授予深圳南方製藥廠“軍隊模範企業”榮譽稱號。
4月，深圳南方製藥廠被評為全國先進集體，榮獲全國“五一”勞動獎狀。
5月25日，深圳南方製藥廠位居全國最大規模醫藥工業企業第一位。
●1994年大事記
6月22日，國務院發展研究中心等單位授予趙新先同志“中國經營大師”稱號。
10月12日，清華大學經濟管理學院聘任趙新先同志為客座教授。
11月7日，深圳南方製藥廠被深圳市政府授予“納稅大戶”稱號。
11月20日，趙新先同志被評為 “中國改革十大風雲人物”。
●1995年大事記
5月1日，美國紐約時代廣場樹起第一塊中文廣告牌“三九藥業”。
8月22日，國家統計局等單位聯合授予深圳南方製藥廠“中國製藥之王”稱號。
●1996年大事記
1月26日，“三九胃泰”獲俄羅斯衛生部批准，成為中國首個在俄羅斯銷售的中成藥產品。
4月16日，95中國最有價值品牌在北京公布，“999”品牌價值34.17億元，名列第六位。
5月17日，深圳市第一家企業博士後工作站三九醫藥研究院企業博士後工作分站掛牌。
●1997年大事記
3月，深圳南方製藥廠生產的三九感冒靈沖劑、三九正天丸，以及下屬的深圳九新藥業有限公司三九頭孢曲松鈉（注射用）等產品獲“軍隊企業名牌產品”稱號。
4月，三九集團被列入全國第二批試點企業集團名單，成為全國12家試點企業集團之一。
●1998年大事記
2月下旬，由《經濟日報》社、中國質量萬里行、北京名牌資產評估事務所等單位舉辦的97最有價值品牌榜發布，“999”品牌價值為42.52億元，列排行榜第六位、全國醫藥行業之首。
3月，深圳南方製藥廠生產的“三九胃泰”、“正天”商標在“人用藥物”類獲準在新家坡續展註冊，此次續展有限期限為十年。
7月16日，三九集團受讓上市公司“宜春工程”的股權，實現買殼上市，2000年3月，該公司更名為“三九宜工生化股份有限公司”。
8月21日，三九集團累計向遭受水災的軍民捐贈2269萬元的藥品和資金。
12月25日，遵照中共中央、國務院、中央軍委的指示，三九集團軍企移交，轉由中央企業工委直接領導。
●1999年大事記
1月上旬，"999"商標經國家工商行政管理局嚴格審查，被正式認定為"中國馳名商標"。
2月1日，北京名牌資產評估事務所公布'98中國最有價值品牌研究報告，"999"品牌的價值升至47.33億元人民幣，比上年增長11.3個百分點，位居全國醫藥行業榜首。
3月18日，時任全國人大常委會副委員長的吳階平在京為三九醫院題寫院名。
5月17日-18日，深圳南方製藥廠黨委召開擴大會議，提出了“艱苦創業，實業報國，把南方製藥廠建成世界最大植物藥廠”的發展目標。
9月上旬，國家經貿委發布'99年度統計年報，對全國藥業工業企業分別按銷售收入、利潤總額、利稅總額三項指標重新排序，深圳南方製藥廠以462957萬元銷售收入、49122萬元利潤、74316萬元利稅名列全國製藥企業500強榜首，成為中國藥業的行業龍頭。
9月，美國《財富》雜誌中文版第15期發表對中國500家外資企業的專題調查報告，三九藥業在"整體上最受讚賞的公司"中名列全國第八。
10月5日-10日，中國國際高新技術成果交易會在深圳舉行，"999中藥電子調配中心"和"999免煎中藥飲片"在會上引起關注，被譽為推進中醫藥現代化的重大科技成果。時任國務院總理的朱鎔基觀看演示後稱讚說：“三九又有創新”。時任國務委員的吳儀高度評價說：“這是中醫藥的一場革命!”
10月12日-17日，三九醫藥與衛生部國際交流司共同舉辦的“'99中美院長醫院管理研討會”，先後在北京、上海、深圳舉行。
11月3日-5日，“三九醫藥股份有限公司A股發行路演推介會”先後在北京和深圳兩地舉行。三九醫藥的A股發行獲得成功，發行總額為2億元，其中1.2億元配售股份很快被大眾科創、橫店集團等42家戰略投資者搶購一空，上網發行的8000萬元A股，凍結資金2456億元，創造當時中國股市一項新紀錄。這次A股發行，共募集資金17億元人民幣。
11月中旬，"999中藥電子調配中心"項目被正式納入國家"863計畫"。
12月1日-4日，99年度中國最有價值品牌發布會在青島召開，"999"價值49.18億元，躍居全國第十位，蟬聯全國製藥行業第一名。
2000年後
●2000年大事記
2月21日，時任中共中央總書記的江澤民在深圳高新技術展示會上觀看了 “999中藥電子調配中心” 的展示，高興地說：“這對病人很方便，這個項目很有發展前途”。
3月9日，三九醫藥A股在深圳市證券交易所掛牌上市。
4月24日，999健康網開通新聞發布會在北京舉行。
5月中旬，深圳南方製藥廠技術中心被認定為國家級企業技術中心。
7月初，“三九胃泰”進入《國家基本醫療保險藥品目錄》，同時進入的還有正天丸、壯骨關節丸等。
7月16日至18日，三九醫藥分別在北京、深圳等地舉行新聞發布會，宣布將999頭孢噻肟鈉大幅降價。
7月中旬，國家經貿委公布1999年度全國製藥工業100強三項經濟指標排序，深圳南方製藥廠在銷售收入、利潤、利稅三項指標，均繼1998年度後再次蟬聯第一。
7月30日，“三九連鎖藥店戰略研討會”召開，會議確定三九進軍連鎖藥店的發展計畫。
9月8日至9日，由三九醫藥承辦的2000年中國醫院院長高級論壇在北京舉行。時任全國人大常委會副委員長的吳階平等出席會議並致詞。
9月10日上午，“999中藥電子調配中心”項目通過國家863計畫專家組驗收。
10月12日，時任國務院副總理的吳邦國視察深圳南方製藥廠。
10月中旬，三九醫藥獲準進行網上售藥試點。
11月16日，國家藥品監督管理局發出《關於立即暫停使用和銷售含PPA藥品的緊急通知》，不含PPA的“999感冒靈”成為國內治療感冒的首選良藥。
12月8日，’2000中國最有價值品牌發布，“999”品牌價值升至73．88億元，繼續列全國製藥行業第一位。
●2001年大事記
2月，首批價值148萬元的585箱370多個品種的“999中藥配方顆粒”和一台三九中藥電子調配櫃飄洋過海運抵加拿大。
3月8日至11日，在美國加利福尼亞州阿納海姆市，三九醫藥首次應邀參加了2001年天然產品世界商展會?Natural Products Expo West2001。
3月，三九醫藥與荷蘭Letan公司在荷蘭首都阿姆斯特丹簽下了第一筆訂購“999中藥配方顆粒”的訂單。此次簽約，標誌著“999中藥配方顆粒”正式進入了歐洲市場。
4月9日， “999”商標被評為“中國最高認知率商標”。
4月15日，深圳第一家999連鎖藥店——深圳書城分店隆重開業。
4月19日，隨著國家“863”計畫智慧型機器人主題產業化基地掛牌，全國醫藥行業首家由科技部批准和認定的國家“863”成果產業化基地在三九醫藥誕生。
5月23日，三九中醫藥醫療中心在加拿大多倫多北約克市開業，這是三九醫藥創辦的第一家國際傳統中醫藥診所。
6月11日， “三九本草坊藥業株式會社”在日本成立。
7月28日，奧地利“三九中國健康中心”揭牌儀式隆重舉行。
8月26日至27日，由衛生部國際交流中心與三九醫藥聯合主辦的“2001年中國醫院院長高級論壇”在大連召開。
8月27日，中國證監會通報批評三九醫藥股份有限公司大股東占用上市公司巨額資金25億元，並決定對有關違法違規行為進行立案稽查。隨後，三九醫藥就違規一事，先後接受了《人民日報》、中央電視台、《光明日報》、《中國證券報》、《證券時報》等新聞媒體的採訪。三九醫藥股份有限公司董事會為此多次召開會議，商討整改方案，在發布公告向廣大股民和社會各界誠懇道歉的同時，積極實施整改方案。
11月13日，全國人大副委員長、我國醫學界泰斗、兩院院士吳階平在廣州視察了廣東三九腦科醫院，稱讚三九集團為社會提供了一個高起點、高質量、現代化的專科醫院，題辭勉勵醫護人員：勇攀醫學科學高峰，不斷提高診斷水平
12月19日，2001年中國最有價值品牌研究揭曉，“999”品牌升值為81．16億元。
●2002年大事記
3月12日，三九現代中醫中藥產業化研究開發基地（簡稱"三九中醫中藥谷"）項目，在北京中關村科技園昌平區隆重舉行簽字儀式暨奠基典禮。
3月，國家發展計畫委員會下發檔案，同意“999中藥電子調配中心”項目列入國家高技術產業發展項目計畫。
4月10日，"衛生部999中藥注射液科研基金"在北京正式成立。
4月，"999"商標在第二屆中國商標大賽中獲"2001年中國十大公眾喜愛商標"榮譽。
6月2日，美國三九現代中醫藥研究院、美國三九威達國際連鎖中醫藥醫療中心，在美國洛杉磯掛牌開業。
6月13日，三九醫藥順利通過國家藥品監督管理局的審批，成為中藥配方顆粒試點生產企業。
6月25至28日，廣東省政府主辦的"中國廣東（俄羅斯）貿易暨經濟技術洽談會"及"中國廣東（俄羅斯）商品展銷會"在莫斯科全俄展覽中心舉行，三九醫藥參展。
7月，三九醫藥連鎖藥店進入快速發展期，至7月底已建成門店600多家，分布在全國15個省份的23個城市。
8月，三九健康網公布新的域名和標誌，並實現了從健康資訊提供商向健康服務提供商的轉變，從公眾服務、虛擬服務向個性服務與大眾服務相結合、虛擬服務與實體服務相結合的轉變。
9月19日，深圳南方製藥廠在廣東東莞召開黨委擴大會議，全面總結建廠16年來的創業歷程和發展成就，提出“全面建設現代中醫中藥產業跨國集團”的奮鬥目標。
11月3日，時任全國政協副主席的陳錦華視察廣東三九腦科醫院。
12月4日，由北京名牌資產評估有限公司評估的2002年度中國最有價值品牌揭曉，"999"升值為82．08億元，位列中國名牌第十名，繼續居全國醫藥行業之首。
●2003年大事記
7月21至22日，三九醫藥產業管理工作會議在深圳召開，研究三九醫藥產業的體制改革和管理措施，提出“強化統管、整合發展、監督約束、增創效益”的總體要求。
12月5日，2003中國最有價值品牌揭曉，“999”品牌以83.06億元的價值繼續居醫藥行業首位。
●2004年大事記
3月18日，三九醫藥與科技部研製開發的世界上第一台適用於中西藥自動配發作業的智慧型化藥房在深圳研製成功。該項目集配藥和發藥於一體，從取藥、包裝、列印標籤到安全高效的數據管理，提供全面自動的解決方案，給廣大患者帶來方便，也為醫院藥房改革帶來實質性的突破。
6月，999皮炎平被國家科技部列入2004國家級重點產品項目，享受國家對重點新產品的優惠政策。
9月，國家勞動和社會保障部公布了2004年版《國家基本醫療保險和工傷保險藥品目錄》，三九醫藥生產的三九胃泰、正天丸、參附註射液、參麥注射液、生脈注射液、魚腥草注射液、丹參注射液、香丹注射液、九華痔瘡栓、人血白蛋白、頭孢噻肟鈉、頭孢曲松鈉、頭孢他啶等系列產品入選。
12月13日，2004年中國最有價值品牌研究報告發布，“999”品牌價值83.06億，位列中國最有價值品牌第13名，連續十年位居中國最有價值醫藥品牌榜首。
●2005年大事記
1月23日，"2004中國十大影響力品牌"新聞發布會暨首屆中國品牌影響力高峰論壇年會在北京召開。"999"評為中國行業十大影響力品牌。
3月1日，三九商標管理小組成立，全面負責對外打擊假冒、仿冒商標侵權行為，整頓規範集團內部商標使用，以及三九商標的品牌建設維護。
3月，為了全面實現三九的新崛起，做實做強做大醫藥產業，在充分調查論證的基礎上，三九集團決定在深圳市高新技術產業帶觀瀾園區建設三九醫藥工業園。三九醫藥工業園將建設成為國內一流的植物藥生產基地、頭孢類抗生素生產基地、保健食品以及醫藥產品包裝生產基地，力爭使三九在最短的時間內重回國內醫藥企業的領先地位。
4月2日至4日，三九醫藥參展在廈門舉行的第53屆全國藥品交易會，圍繞"眾星同輝、健康共創"這一主題，全面展示三九醫藥新形象，提升三九品牌的價值和認知度。
4月30日，三九企業集團與三家上市公司年報同期公告了三九生化、三九發展國有股權轉讓的情況。
8月，雅安三九藥業有限公司生產的“生脈注射液”，被國家食品藥品監督管理局繼續列為國家中藥保護品種，保護期限為七年。生脈注射液2001年就被列為國家中藥保護品種。2004年11月，雅安三九申報延長中藥品種保護期限。生脈注射液這次被繼續列為國家中藥品種保護，既提升了產品的知名度，又提高了企業的經濟效益。
8月，三九醫藥新藥五水頭孢唑林鈉（999螯合新泰林）獲得了國家食品藥品監督管理局新藥證書和生產批文。五水頭孢唑林鈉由九新藥業有限公司和中國藥品生物製品檢定所合作研製開發，屬國內四類新藥，是治療革蘭氏陽性菌感染最有效的頭孢製劑之一，在臨床上有著十分廣泛的套用五水頭孢唑林鈉的推出，填補了國內抗生素的空白。
9月8日，為進一步深化人事制度改革，三九醫藥啟動全員競聘上崗工作。
11月18日，地處深圳市觀瀾高新科技園區內的三九醫藥工業園開工奠基。
12月6日，北京名牌資產評估有限公司發布了2005年度中國最有價值品牌評價結果，“999”品牌價值為83.06億，與2004年度持平，位列中國最有價值品牌第18位。
12月17日，2005中國醫藥品牌風雲榜評選揭曉，三九胃泰、三九感冒靈被評為2005百姓信賴藥品品牌。
●2006年大事記
1月10日，中國品牌研究院在廣州發布“中國100最有價值馳名商標”排行榜，三九商標位居藥品行業第一位。
1月20日，深圳市在“中國生命科技高峰論壇”上提出，為造就一批具有國際競爭力的大企業，確定三九醫藥等為深圳重點支持企業。
3月，九新藥業有限公司研製的新藥"999螯合新泰林"獲得國家知識產權局頒發的發明專利證書，產品獲得長達20年的專利保護。
4月22日，主題為“關愛家庭，關注健康”999家庭小藥箱健康教育活動在北京啟動，在北京、廣州、深圳等10個重點城市相繼展開。
5月，999中藥配方顆粒質量標準（內控）第二版的研究修訂工作已基本完成。此版質量標準涵蓋了三九現代中藥有限公司現有全部中藥配方顆粒500個品種，而且在檢驗技術方法上較第一版也有了很大的提高,標誌著三九中藥配顆粒在生產工藝水平和質量控制方面上了一個新台階。
5月，三九醫藥兩個政府資助研發項目順利通過驗收。這兩個項目為"生脈製劑產業化暨國際化"、"一類生物工程新藥重組人複合干擾素ɑ（優福金）的研發與產業化"項目，均是深圳市高技術產業化示範工程，曾獲得深圳市發改局經費資助。
6月12日，三九醫藥工業園樁基礎工程施工啟動。
12月，三九醫藥兩項科技成果通過鑑定，這兩項成果為“正天丸劑型改進工藝關鍵技術研究”、“999感冒靈顆粒生產工藝改進及質量標準提高的研究”。鑑定委員會認為，成果處於國內領先水平。
12月，三九醫藥的“解郁膠囊的臨床研究及產業化”項目，獲得2006年粵港關鍵領域重點突破項目資助，資助金額為100萬元。
●2007年大事記
3月，國資委決定華潤集團託管三九集團，經國資委批准的三九集團“管委會”對三九集團的重組和重要工作開始實施管理。
3月23日，華潤集團董事長陳新華、總經理宋林一行來到三九集團，與集團中層以上幹部首次見面。
3月，九新藥業有限公司自主研發的“五水頭孢唑林鈉”原料及製劑，獲國家重點新產品稱號，有效期為3年。公司每年享受抵稅150萬元左右的優惠政策。此前，“五水頭孢唑林鈉”原料及製劑於2005年7月獲得國家新藥證書，“五水頭孢唑林鈉”晶體及製備於2006年3月獲得專利授權。
3月，三九醫藥股份有限公司獲得凝膠劑（含激素類）、顆粒劑、膠囊劑三個劑型的GMP證書。至此，三九醫藥完成了乳膏劑（含激素類）、丸劑、顆粒劑、膠囊劑、片劑、凝膠劑（含激素類）所有劑型的GMP認證，以及乳膏劑（含激素類）、顆粒劑、膠囊劑5年效期的復認證工作。
9月28日，在中華世紀壇舉行的“中國高新技術產業發展高峰會暨產業先鋒頒獎典禮”上，三九醫藥旗下九新藥業有限公司生產的新泰林（五水頭孢唑林鈉）被評為“中國高新技術產業優秀品牌”。此前，該產品還被評為“國家重點新產品”。
9月，在成都召開的中成藥優質優價評審會上，三九醫藥生產的999感冒靈通過專家組評審，成為“中成藥優質優價”品種，這是感冒靈品類唯一獲得該資格的產品。
9月，在中國非處方藥協會自我藥療年會上，公布了非處方藥企業及細分領域OTC產品年度排名，三九醫藥多個品種名列前茅：999感冒靈顆粒位列中成藥感冒咳嗽類第一名；999正天丸位列中成藥頭痛失眠類第一名；999皮炎平位列化學藥外用類第二名；三九胃泰位列中成藥消化類第四名。三九醫藥股份有限公司位列中國重點醫藥生產企業非處方藥第四名。
11月中旬，深圳科技局授予三九醫藥股份有限公司“深圳市高新技術企業”稱號，將享受深圳科技資助和重點扶持等相關政策的優惠。
11月，在2008年央視黃金時段廣告招標會上，三九醫藥一舉中標央視一套《焦點訪談》黃金時段廣告位。
11月27日，國務院國資委宣布華潤集團全面接管三九集團。三九醫藥正式加入華潤大家庭。
12月18日，三九醫藥股份有限公司發布公告，詳細披露了董事會審議通過的大股東及其關聯方占用的37.58億元資金的清償方案。作為滬深證券市場的清欠重點，三九醫藥的清欠一直受到市場各方的極大關注。本次期待已久的清欠方案的公布，標誌著三九醫藥的資金占用解決工作已取得重大進展，清欠正式進入倒計時。
12月底，三九醫藥所持有的三九生化38.11%股權過戶給了振興集團及相關方。至此，三九生化的處置工作進入尾聲。
● 2008年大事記
3月23日至24日，三九醫藥2008年度經理人年會在深圳召開。會議明確提出，三九醫藥今後將以發展戰略為核心，以業績文化為導向，以6S為工具，強化基礎管理，全面提升上市公司經營管理水平。
4月11日，國家藥監局調研組到三九醫藥進行專題調研，深入了解中藥配方顆粒劑型開發、生產和銷售等情況。
4月底，三九醫藥新生產基地獲得國家食品藥品監督管理局頒發的“生產許可證”和“GMP認證”證書。三九醫藥是廣東省食品藥品監督管理局首次對企業進行“生產許可證”及“GMP認證”同時驗收的試點單位。公司投資建設的新生產基地在“兩證”認證的各項檢查中，一次性順利通過驗收。
5月8日，三九醫藥工業園落成投產，對上市公司在推動中藥現代化、擴大生產能力、加快新產品開發、提高產品質量和市場占有率，以及提升“999”品牌價值等方面，起到全方位的促進作用，為實現公司持續、健康、快速發展打下良好的基礎。
5月30日，三九醫藥2008年投資者見面會在深圳聖廷苑酒店舉行，此次見面會的主題是“新視野、新價值、新三九”。會上，公司高管與40多位基金經理、證券分析師圍繞三九醫藥的成長性，進行了面對面交流和溝通。
6月16日，由三九醫藥股份有限公司主辦的“中藥配方顆粒學術研討會”在北京召開。這次會議明確提出了中藥配方顆粒的新的定位，對中藥配方顆粒的發展和進一步研究工作提出了指導性意見，對中藥配方顆粒的健康、持續發展以致國際化將起到非常重要的作用。
6月27日，雅安三九藥業抗震救災小分隊受到華潤集團表彰。該集體此後於8月下旬受到國務院國資委隆重表彰。
9月2日，三九醫藥推出新股改方案。
9月26日，三九醫藥股權分置改革相關股東會在深圳本部召開，會上宣布決議：三九醫藥股份有限公司股權分置改革項目順利過關。隨著三九醫藥股改的順利沖關，為上市公司在資本市場的拓展奠定了堅實基礎，標誌著三九醫藥進入了全新的發展時代。
12月3日，由馬來西亞華人醫藥總會理事長盧映輝先生帶隊，馬來西亞中醫師代表團一行24人到三九醫藥股份有限公司本部訪問。
● 2009年大事記
1月15日至16日，三九醫藥股份有限公司經營工作會議在深圳召開。會議明確：2009年，上市公司將大力推進和落實五項戰略舉措和八項具體工作，從“基礎管理年”轉向“成本效益年”。
1月下旬，三九醫藥PDMP（業績及發展管理流程）項目啟動會在深圳召開。三九醫藥是華潤醫藥“領導力發展項目”試點單位，也是華潤集團首家實施PDMP項目的企業。
2月11日，國家食品藥品監督管理局副局長吳湞，紀檢組長李東海率調研組，到三九醫藥股份有限公司考察。
2月11日至14日，新加坡中醫師代表團一行30人來到深圳，參觀訪問三九醫藥。
3月13日至15日，三九醫藥2009年度經理人年會在深圳召開。會議以上市公司戰略規劃為導向,提出了2009年的管理目標,以及五項戰略舉措和八項具體工作。14家下屬企業負責人分別與公司簽訂了2009年經營責任書。
3月17日,三九醫藥與廣大投資者相聚在深圳喜來登酒店會議廳。在這次以“機遇.變革.成長”為主題的見面會上，三九醫藥高管向與會基金經理、證券分析師等投資者介紹公司2008年度業績，並就公司未來發展、醫藥企業如何應對新醫改帶來的機遇和挑戰等話題，進行了面對面交流和探討。
4月7日，中國工程院院士、天津中醫藥大學校長張伯禮一行，來到三九醫藥股份有限公司深圳總部，就“壯骨關節丸”安全性研究及二次開發等工作與公司研發事業部研究人員進行了研討。
6月底，經過廣東省食品藥品監督管理局現場檢查，三九醫藥工業園全自動化運行的高架立體倉庫獲得GSP資質，在深圳市三九醫藥貿易有限公司經營許可證中，將添加新倉庫地址，這標誌著三九醫藥工業園已納入完善的GMP、GSP管理體系，上市公司生產管理、物流管理邁上了新的發展平台。
6月下旬，三九醫藥（000999）榮登2008年度中國上市公司“金牛百強”和“價值百強”榜。自7月1日起，三九醫藥（000999）調入滬深300指數，同時入選滬深300相對成長指數、滬深300相對價值指數、滬深300醫藥衛生指數以及中證中盤200指數。此前，三九醫藥（000999）已入選深圳證券交易所100成份指數。這充分說明三九醫藥上市公司受到資本市場的高度認可。
6月25日，同濟大學裴鋼校長帶領“中醫大師傳承人才”班專家共13人來到深圳，參觀訪問三九醫藥股份有限公司總部。
7月20日，首屆中國最具競爭力醫藥上市公司20強及最具投資價值醫藥上市公司10強在北京揭曉，三九醫藥股份有限公司（000999）在20強榜中位列第四。此次評選活動由中國醫藥企業管理協會、《醫藥經理人》聯合主辦。
8月18日，衛生部、國家發改委等九部委正式頒布《國家基本藥物目錄》，三九醫藥股份有限公司共有68個品種進入《國家基本藥物目錄》，其中三九胃泰顆粒和正天丸（膠囊）兩個獨家中藥品種進入《國家基本藥物目錄》。
8月25日，三九醫藥股份有限公司“單味中藥濃縮顆粒劑技術改造”項目，獲得深圳市貿易工業局下發的“項目竣工驗收結果通知書”。單味中藥濃縮顆粒劑技術改造”項目，於 2002年被列入國家第三批重點技改造項目之列，並在當年獲得國家2037萬元人民幣的專項資金補助。
10月25日，華潤集團總經理喬世波等視察了江西三九藥業有限公司，重點了解該公司併購項目工作進展情況。
11月10日，三九醫藥發布公告稱：董事會決議公司名稱由“三九醫藥股份有限公司”變更為“華潤三九醫藥股份有限公司”，將“華潤”字號植入公司名稱，有利於藉助華潤集團在國內市場的影響力和醫藥產業資源促進公司業務成長。
2008年，華潤三九躋身於中國上市公司價值百強企業，並於2009年7月1日起，列入滬深300指數，深證100成份指數。經過多年發展，華潤三九逐步形成了自身的優勢和實力。品牌優勢：公司具有較強的細分市場產品品牌運作經驗，“999”品牌知名度高，目標客戶接受度高，是皮膚藥和感冒藥市場的領導品牌。渠道優勢：公司商業網路覆蓋全國。現有的合作夥伴基本涵蓋了國內最優質的醫藥商業資源。規模和質量優勢：公司主要單品種銷售規模大，產品質量穩定。
2009年華潤三九實現營業收入48.53億元，同比增長11.48%；營業利潤8.85億元，同比增長39.75%；淨利潤7.09億元，同比增長42.33%，每股收益0.72元。公司所生產的999品牌系列產品，在國內藥品市場上具有相當高的占有率和知名度，單品種2009年銷售均超過億元人民幣。其中，999感冒靈系列2009年銷售額超過10億元（含稅），位居感冒藥市場第一；999皮炎平2009年銷售額近5億元（含稅）。
2010年，華潤三九實現營業收入43.65億元，2011年實現歸屬於母公司所有者的淨利潤約8.16億元，經營活動產生的現金流量淨額8.48億元。截至2010年底，公司總資產為65.9億元。
2011年，華潤三九實現營業收入55.25億元，2011年實現歸屬於母公司所有者的淨利潤7.6億元，經營活動產生的現金流量淨額9.55億元。截至2011年底，公司總資產為76億元。
地址
本公司註冊地址和總部地址原為廣東省深圳市羅湖區銀湖路口。
2013年1月始，已變更為“深圳市龍華新區觀瀾高新園區觀清路1號華潤三九醫藥工業園”。
