2018年2月6日,華夏甯氏根祖文化研究院被民政部社會組織管理局列入非法社會組織。 2017年6月23日,民政部民間組織管理局主管的中國社會組織網曝光第三批未在民政部登記的組織名單,華夏甯氏根祖文化研究院在名單中。2018年2月6日,民政部公布一批非法社會組織名單,華夏甯氏根祖文化研究院在名單中。