莊昀筠，女，博士，現任中國海洋大學環境科學與工程學院副教授。
基本介紹
- 中文名：莊昀筠
- 學位/學歷：博士
- 職業：教師
- 專業方向：海洋浮游生物分子生態學及功能基因組學
- 任職院校：中國海洋大學環境科學與工程學院
個人經歷,研究方向,學術成果,
個人經歷
教育背景：
2007/8 - 2013/5：美國康乃狄克大學（University of Connecticut），海洋學，博士
2003/9 - 2007/6：中國海洋大學，生物科學，學士
工作經歷：
2017/8 -今：中國海洋大學，環境科學與工程學院，“青年英才工程”，副教授
2014/4 -2017/3：中國海洋大學，環境科學與工程學院，博士後
2011/5-2011/7：美國克雷格·文特爾研究所（J. Craig Venter Institute），訪問學者
研究方向
主要從事海洋浮游生物分子生態學及功能基因組學研究工作。
- mRNA剪接前導序列在海洋橈足類中的普適性與特異性。
2.利用組學技術研究浮游生物對環境變化的回響及適應機制：（1）浮游植物對營養鹽的吸收同化機制、細胞周期及其調控；（2）橈足類對環境污染物的分子回響機制。
3.利用DNA條形碼技術研究：（1）浮遊動植物生物多樣性；（2）橈足類現場食物多樣性及其攝食習性。
學術成果
科研項目：
1.國家自然科學基金青年基金項目：mRNA剪接前導序列在海洋橈足類中的普適性與特異性研究（31502167），2016.1-2018.12，21萬元，主持。
2.中國博士後科學基金面上項目：海洋橈足類反式剪接前導RNA的鑑定及表達分析（2015M582137），2015.11-2017.3，5萬元，主持。
3.國家重點研發計畫項目課題：海洋典型生態系統儲碳過程的調控機制（2016YFA0601202），2016.7-2021.6，468萬元，參加。
4.國家自然科學基金青年基金項目：西北太平洋典型海域浮游橈足類晝夜垂直移動及其現場食物多樣性研究（41506131），2016.1-2018.12，22萬元，參加。
5.國家自然科學基金海外及港澳學者合作研究基金項目：利用分子生態學方法研究環境污染物對海洋橈足類的毒理效應（41328009），2014.1-2015.12，20萬元，參加。
代表性論文：
1.Zhuang Y, Yang F, Xu D, Chen H, Zhang H*, Liu G*. Spliced leader-based analyses reveal the effects of polycyclic aromatic hydrocarbons on gene expression in the copepodPseudodiaptomus poplesia.Aquatic Toxicology. 2017. 183, 114-126.
2. Yang F, Xu D,Zhuang Y, Yi X, Huang Y, Chen H, Lin S, Campbell DA, Sturm NR, Liu G*, Zhang H*. Spliced leader RNA trans-splicing discovered in copepods.Scientific reports. 2015. 5:17411.
3.Zhuang Y, Zhang H, Hannick L, Lin S*. Metatranscriptome profiling reveals versatile N-nutrient utilization, CO2limitation, oxidative stress, and active toxin production in anAlexandrium fundyensebloom.Harmful Algae. 2015. 42, 60-70.
4. Lin S*, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W, Li L, Zhang Y, Zhang H, Ji Z, Cai M,Zhuang Y, Shi X, Lin L, Wang L, Wang Z, Liu X, Yu S, Zeng P, Hao H, Zou Q, Chen C, Li Y, Wang Y, Xu C, Meng S, Xu X, Wang J, Yang H, Campbell DA, Sturm NR, Dagenais-Bellefeuille S, Morse D, 2015. TheSymbiodinium kawagutiigenome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis.Science350, 691-694.
5.Zhuang Y, Zhang H, Lin S*. Polyadenylation of 18S ribosomal RNA in algae.Journal of Phycology.2013. 49(3): 570-579.
6.Zhuang Y, Zhang H, Lin S*.Cyclin B gene and its cell cycle-dependent differential expression in the toxic dinoflagellateAlexandrium fundyenseAtama Group I/Clade I.Harmful Algae.2013.26: 71-79.
7. Lu W,Zhuang Y, Zhang H, Lin X, Lin S*. DNA barcoding species inAlexandrium tamarensecomplex using ITS and proposing designation of five species.Harmful Algae.2014. 21: 100-113.
8. Zhang H*,Zhuang Y, Gill J, Lin S*. Proof that dinoflagellate spliced leader (DinoSL) is a useful hook for fishing dinoflagellate transcripts from mixed microbial samples:Symbiodinium kawagutiias a case study.Protist.2013. 164(4): 510-527.
9. Kuo RC, Zhang H*,Zhuang Y, Hannick L, Lin S*.Transcriptomic study reveals widespread spliced leader trans-Splicing, Short 5’-UTRs and potential complex carbon fixation mechanisms in the Euglenoid AlgaEutreptiellasp.PLoS One2013. 8(4), e60826.
10. Miranda LN,Zhuang Y, Zhang H*, Lin S*. Phylogenetic analysis guided by intragenomic SSU rDNA polymorphism refines classification of “Alexandrium tamarense” species complex.Harmful Algae.2012.16:35-48.
11.Chan CX, Blouin NA,Zhuang Y, Zäuner S, Prochnik SE, Lindquist E, Lin S, Benning C, Lohr M, Yarish C, Gantt E, Grossman AR, Lu S, Müller K, Stiller JW, Brawley SH, Bhattacharya D*.Porphyra(Bangiophyceae) Transcriptomes provide insights into red algal development and metabolism.Journal of Phycology.2012.48:1328-42.
12. Lin S*, Zhang H,Zhuang Y, Tran B, Gill J. Spliced leader-based metatranscriptomic analyses lead to recognition of hidden genomic features in dinoflagellates.Proc Natl Acad Sci USA.2010. 107(46):20033-20038.
國際會議報告：
1.Zhuang Y, Zhang H, Huang Y, Liu G, Lin S. Using 454 pyrosequencing to study in situ diet of marine copepod Calanus sinicus. PICES Annual Meeting: Change and Substainbility of the North Pacific, 2015, Qingdao.Best Oral Presentationawarded by Biological Oceanography Committee of PICES.
2.Zhuang Y, Wang W, Chen H, Huang Y, Pan Y, Zhang H, Liu G. Metabarcoding reveals the effects of asian dust on the taxonomic composition of a northwest pacific plankton assemblages. 13Annual Meeting Asia Oceania Geosciences Society, 2016, Beijing. (Oral presentation)
3.Zhuang Y, Zhang H and Lin S. Polyadenylation of 18S ribosomal RNA in algae. 51Annual Northeast Algal Symposium. 2012. Schoodic Point, ME, USA.
4.Zhuang Y, Zhang H and Lin S. 454 pyrosequencing for eukaryotic microbes: dinoflagellates as a focus. 50Annual Northeast Algal Symposium. 2011. Woods Hole, MA, USA. (Oral presentation)
5.Zhuang Y, Zhang H and Lin S. Expression profiling of mitotic cyclin in toxic dinoflagellate,Alexandrium fundyense. 14International Conference on Harmful Algae, 2010. Hersonissors, Crete, Greece.
6.Zhuang Yand Lin S. Regulatory network of cell cycle in marine phytoplankton. 63Phycological Society of America annual meeting with Plant Biology, 2009. Honolulu, HI. (Oral presentation)
7.Zhuang Y, Zhang H and Lin S. Regulatory pathways of cell division cycle and signal transduction in dinoflagellates (KarlodiniumandAmphidinium): insights from full-length cDNA sequencing. International Plant & Animal Genome Conference XVI, 2008. San Diego, CA.
