良種場財務管理體制，是由國家經濟體制和良種場的發展狀況決定的。所謂良種場的財務管理體制，是規定在資金運動過程中，良種場與國家、良種場內部的權責劃分與組成體系的制度。也就是國家對良種場在組織和管理財務工作方面的組織體系以及維護這一體系正常運轉所要遵循的基本制度。它包括國家對良種場的管理、良種場內部的財務管理和在資金的籌集、運用、耗費、回收和分配上制定的一套具體實施的規則、制度、形式、方法。主要內容如：領導（或隸屬）關係的確定、財務職能機構的設定、職權範圍的劃分以及相應管理制度的制定等。良種場財務管理體制，包括兩個基本的組成部分，一是各級政府對良種場的財務管理體制，二是良種場內部的財務管理體制。就各級政府對良種場的財務管理體制而言，主要是通過各級政府的財政部門和主管部門，由主管部門直接行使管理權力，從上到下實行歸口分級管理。在管理上，採用行政、經濟和法制的方法，對良種場的生產經營活動進行領導、監督控制和調節。隨著經濟體制改革的深入發展，對良種場的管理正從以行政管理方法為主向以經濟手段為主的管理方法轉變，以擴大良種場的經營自主權，調動其幹部、職工的積極性，更好地發展良種事業。
