《與冠心病相關的COL4A1/COL4A2基因組位點多態性的功能研究》是依託汕頭大學，由葉曙擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：與冠心病相關的COL4A1/COL4A2基因組位點多態性的功能研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：葉曙
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
近期全基因組相關分析發現了多個與冠心病相關的基因組位點。其中一個位點在13號染色體13q34區間，其中二個單核苷酸多態性（SNP），即rs4773144和rs9515203，與冠心病密切相關。這二個SNP位於COL4A2基因中和COL4A1基因的上游。我們的前期實驗顯示rs4773144影響血管平滑肌細胞COL4A2 mRNA表達水平及細胞凋亡。生物信息學分析顯示這兩個SNP均位於轉錄很活躍的基因組區域，並且rs4773144可能直接影響轉錄因子Sp1的結合。本課題擬採用來自不同個體的血管平滑肌細胞、內皮細胞、動脈粥樣硬化斑塊和血液樣本，檢測這些SNP與COL4A1/COL4A2 mRNA和其編碼的IV型膠原蛋白水平及細胞凋亡情況的關係，並套用染色質共沉澱和等位基因失衡分析、凝膠電泳遷移等多種技術，進一步驗證這些SNP的影響及其分子機制，為了解冠心病的發病機理及新藥研發提供新的理論基礎。
結題摘要
全基因組關聯分析發現冠心病的易感性與染色體13q34區間的單核苷酸多態性（SNP）rs4773144和rs9515203密切相關。這二個SNP位於COL4A2基因中和COL4A1基因的上游。本課題研究它們對血管壁細胞（平滑肌細胞及內皮細胞）、動脈粥樣硬化組織、及冠心病患者的影響。對來自不同個體的血管平滑肌細胞和內皮細胞的分析顯示rs4773144基因型影響COL4A2和COL4A1基因表達水平：在G/G基因型的細胞中的表達水平最低，而在A/A基因型的細胞中的表達水平最高。用rs4773144為A/G基因型的血管平滑肌細胞和內皮細胞做染色質免疫沉澱後進行等位基因失衡分析顯示G等位基因的轉錄活性低於A等位基因。凝膠電泳遷移率分析顯示rs4773144位點的DNA能夠與核蛋白質結合，並且G等位基因與核蛋白質的結合效率低於A等位基因。螢光素酶報告基因分析表明，G等位基因比A等位基因在驅動報導基因表達上有較低的活性。對來自不同個體的血管平滑肌細胞的分析表明，G/G基因型細胞的凋亡率增高。來自不同個體的動脈粥樣硬化組織的免疫組化分析揭示，來自G/G基因型患者的動脈粥樣硬化斑塊中IV型膠原蛋白降低、纖維帽較薄，提示斑塊不穩定。對冠狀動脈造影確診的冠心病患者的研究顯示，G/G基因型患者的心肌梗死發生率增高；心肌梗死通常由斑塊破裂所造成。以上結果表明位於染色體13q34區間與冠心病易感性相關的SNP影響COL4A2 和COL4A1基因的表達，血管平滑肌細胞的存活和動脈粥樣硬化斑塊的穩定性。該研究結果為冠心病的發病機理及新藥研發提供新的理論基礎。
