“美洲狼尾草圖形泛基因組”是四川農業大學草業科技學院黃琳凱教授團隊構建的全球首個牧草領域圖形泛基因組。
發展歷史,社會影響,
發展歷史
2019年，黃琳凱教授團隊首次公布了鴨茅的高質量參考基因組，是中國公布的首個牧草參考基因組。隨著研究的深入以及技術的進步，構建高質量的圖形泛基因組成為黃琳凱教授團隊的重要目標。
2023年3月3日，這一研究成果以《Pangenomics identifies structural variation associated with heat tolerance in pearl millet》為題在國際權威學術期刊《自然遺傳學》(Nature Genetics)線上發表。
社會影響
起源於非洲的美洲狼尾草，能夠適應極端高溫的氣候，是研究植物耐熱機制的優良材料。本次研究通過對水稻、玉米、高粱等多個物種進行比較基因組學分析，發現美洲狼尾草中擴張的RWP-RK轉錄因子家族和內質網相關基因協同參與耐熱性調控，挖掘並驗證到關鍵結構變異和調控候選基因3個，其中基因PMF0G00024.1(RWP-RK)在水稻中過表達也顯著提高了耐熱性，將為分子育種提供重要靶點。
