《羅氏沼蝦GTPases多樣性分析及其在先天免疫中的功能研究》是依託南京師範大學,由任乾擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:羅氏沼蝦GTPases多樣性分析及其在先天免疫中的功能研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:任乾
- 依託單位:南京師範大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)原產於印度太平洋地區,生活在淡水或鹹淡水水域。羅氏沼蝦屬於節肢動物,無獲得性免疫系統,只能依賴先天免疫系統,抵禦外界微生物的感染。相對於對蝦而言,羅氏沼蝦有更強的抗WSSV能力。已有研究表明,對蝦Ras蛋白超家族成員Ran和Rab通過調節吞噬作用參與抗病毒免疫防禦反應。Ras蛋白是膜相關的小GTPase,該類蛋白在細胞的增值,分化和凋亡中起到重要的作用。另外,在脊椎動物中報導的大GTPases也具有抗病毒功能。我們通過轉錄組測序,在沼蝦中發現了很多小GTPases家族成員, 尤其是發現許多Rab亞家族成員。另外,還發現了大分子量的GTPases。本研究結合生物信息學和分子生物學對沼蝦GTPases多樣性和在先天免疫防禦中的功能進行研究,旨在闡明沼蝦GTPases多樣性與其較強的抗WSSV能力的關係,為沼蝦疾病的防治提供依據。
結題摘要
通過對羅氏沼蝦肝胰腺,受精卵,中腸組織進行轉錄組測序,獲得了大量的免疫相關基因,其中包括該項目要研究的GTPases。我們研究了四類不同的GTPases,包括2種ADP ribosylation factors (MrArf1, MrArf2),11種Rab GTPases, 3種干擾素誘導的大GTPases, 3種Dynamins。在鰓中,MrArf1和MrArf2受WSSV刺激24小時後先下調錶達,在48小時有明顯的上調。在肝胰腺中,MrArf1受WSSV刺激24,48小時上調錶達,MrArf2在24小時上調錶達,48小時回到正常水平。RNAi干擾MrArf1或者MrArf2後,發現VP28表達下調。研究結果表明,WSSV利用宿主的Arfs,提高其複製水平。對蝦的Ral重組表達蛋白,可以抑制病毒的複製,不影響VP28的表達。進化樹分析表明,羅氏沼蝦11種不同的Rabs, 屬於不同的家族。Rab基因廣泛表達,不同程度的受弧菌和WSSV調控。WSSV可以上調錶達干擾素誘導的大GTPases,對其中一種大GTPases進行了干擾,發現其可以調控一種抗菌肽基因的表達。推測,大GTPases可能通過調節抗菌肽的表達,影響病毒的複製。Dynamins也是一種GTPase,研究發現,其受WSSV調控,同時我們的研究發現,Dynamins的表達受STAT基因調控,RNAi將STAT敲低後,dynamins的表達降低。將STAT或者dynamin分別干擾後,影響了WSSV的複製。研究結果表明,STAT基因通過調節dynamins基因的表達,影響了病毒的複製。通過該項目的研究,發現,無論是小GTPases還是大GTPases,在羅氏沼蝦病原的侵染過程中,起到了重要作用。