經營費用審計是指對商業企業在組織商品流通過程中發生的費用所進行的審計，商業企業經營費用，是指商業企業在購、銷、存環節發生的各項費用，包括進貨運雜費、裝卸費、整理費、包裝費、保險費、展覽費、倉儲保管費、檢驗費、廣告費、商品損耗、進出口商品累計佣金、經營人員的工資及福利費等。審計的主要內容：（1）審查營業費用內部控制制度是否健全、有效和可靠；費用管理是否採用統一領導、歸口分級管理的辦法；是否編制費用計畫，分解費用指標，限額控制支出；（2）審查營業費用開支的合法性，各項支出是否遵守國家規定的開支範圍和標準，有無將基本建設支出列入商品流通費、巧立名目、揮霍浪費等現象；對費用合法性的審計，主要通過審查原始憑證來進行；（3）審查營業費用核算的正確性，檢查費用的帳務處理、憑證傳遞是否合規，計算是否正確，有無營私舞弊、虛列支出等的情況；（4）審查營業費用的主要項目，如運雜費、保管費、包裝費、商品損耗、利息和工資支出等是否合理、合法，是否有超計畫定額的浪費現象和亂列費用、非法開支等情況；（5）審計費用管理的嚴密性，核算的1確性、支出費用的合法性，促使企業執行費用開支制度，遵守財經紀律，防止弊端發生；（6）審查費用開支的效益性。被審單位是有計畫地嚴格控制費用支出，促進企業不圖降低費用水平，有利於擴大商品流通，增加積累，防止鋪張浪費。對經營費用審計，必須保證商品流通任務的實現和提高經濟效為出發點，以國家規定的費用開支範圍、支標準、財經紀律和費用計畫或定額為依據進行審查。
