通常病毒中的多肽分為結構多肽和非結構多肽。裝配病毒粒子,組成病毒結構成分的多肽叫做結構多肽。一般是病毒粒子的主要免疫性抗原,抗原決定簇的主要載體。與其不同的時非結構多肽不構成病毒粒子的組成結構,一般起到催化、調節的作用。