短串聯重複序列(short tandem repeat, STR)是核心序列為2-6個鹼基的短串聯重複結構。20世紀90年代初,STR基因座首次作為一種重要的遺傳標記在人類親權鑑定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。
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分型介紹
短串聯重複序列(short tandem repeat, STR)是核心序列為2-6個鹼基的短串聯重複結構。20世紀90年代初,STR基因座首次作為一種重要的遺傳標記在人類親權鑑定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。
細胞STR分型(cell line STR genotyping)D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個具有高度多態性基因座和一個性別基因位點Amelogenin對人源細胞進行STR分型檢測。根據STR分型結果對細胞的生長狀態(是否存在交叉污染)和細胞的株系進行確認的技術手段。
據估計,15-20%的時間裡,實驗中所使用的細胞已經不是原來的細胞系,或者與其它細胞系發生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它細胞庫(Coriell Institute for Medical Research, European Collection of Cell Cultures (ECACC), Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zellkulturen (DSMZ), Japanese Collection of Research Resources)都收到過提交的“錯誤”的細胞系,儘管提交者把細胞系提交到上述機構之前,還經過了檢驗。然而,最終證實這些細胞系還是鑑別錯了(4,5)。此外,幹細胞也可能被污染,作為幹細胞賴以增殖的哺育細胞層,小鼠細胞很容易污染到幹細胞中。顯然,細胞系遭到污染、特徵鑑別錯誤,將會極大地威脅著基於這些細胞而發表的論文的質量和研究發現的正確性。