紋線系統是構成指紋的紋線並非雜亂無章地堆積在一起,而是按照一定的排列順序有規律地排列在一起,形成形態規則的花紋圖形。許多形態和流向相同的紋線排列在一起叫作紋線系統。該系統又可進一步劃分為內部紋線系統、外圍紋線系統和基底紋線系統。
內部紋線系統居於花紋的中心部位,主要由箕形線、環形線、螺形線、曲形線等組成,是指紋的主要部分,其花紋形態決定指紋的紋型。外圍紋線系統從上部及左右兩側包繞內部紋線系統的紋線,主要由弓形線組成。基底紋線系統分布在內部紋線系統的基底部,主要由弧度較小的波浪線和不大平坦的直形線組成。