《系統生物學哲學基礎》是2008年科學出版社出版的圖書，作者是布傑德。
基本介紹
- 書名：系統生物學哲學基礎
- 作者：布傑德
- ISBN：9787030222121
- 頁數：250
- 出版社：科學出版社
- 出版時間：2008-08-01
- 裝幀：平裝
- 開本：16開
內容簡介,章節目錄,前言,
內容簡介
《系統生物學哲學基礎》以一個全新的視角來講述系統生物學，即通過討論構成系統生物學的哲學基礎來理解系統生物學的內涵和本質。對系統生物學的科學哲學進行深入的開放式討論，詳細闡明那些涉及系統生物學基礎的各種哲學問題，以及是什麼使得它與分子生物學如此之不同。作者在書中開展了許多富有啟發和成果性的討論，引導讀者思考系統生物學哲學的核心概念。這些對於系統生物學的學習和研究都是非常有益的。
章節目錄
譯中序
作者簡介
前言
第一篇 引論
1 面向系統生物學的哲學基礎：引言
1.1 系統生物學：一門旨在探尋方法學與哲學基礎的新科學
1.2 系統生物學
1.3 面向系統生物學的哲學
1.4 對幾個系統生物學哲學問題的介紹
1.5 本書的目標和概況
參考文獻
第二篇 系統生物學的研究程式
2 系統生物學的方法論
2.1 自然科學各學科的方法論與哲學基礎
2.2 生物化學和分子生物學科學地位的局限
2.3 突破限制
2.4 系統生物學之方法學
致謝
參考文獻
3 哲學的思想：方法論
3.1 引言
3.2 通過代謝和系統生理學理解複雜的疾病——糖尿病
3.3 MRS和MCA構建了成功的系統生物學方法論
3.4 結論
參考文獻
4 我們怎樣理解新陳代謝
4.1 引言
4.2 傳統的新陳代謝原理
4.3 新陳代謝系統分析的興起
4.4 我們能像期望的那樣去理解新陳代謝嗎？
4.5 一個細胞的新陳代謝通過模擬就能理解嗎？
參考文獻
5 基於不可靠的數據構建可靠的模型：用進化和發育的觀點解讀新系統生物學(NSB)
5.1 引言
5.2 新系統生物學和進化發育生物學(evoo-devo)
5.3 在分析大型系統時數據的可靠性問題
5.4 數據錯誤和“摩爾系統”(molar system)屬性
5.5 魯棒性和不確定因素的控制
5.6 內生固守性
參考文獻
第三篇 理論與模型
6 系統生物學的機制和機械論解釋
6.1 引言：機械論解釋和還原論
6.2 組織的層次與解析度尺度
6.3 乳糖操縱子作為機制模型的發展
6.4 機制與突現
6.5 結論：機械論解釋與系統生物學
參考文獻
7 系統生物學的理論，模型和方程
7.1 引言：生物學的理論結構
7.2 動作電位的Hodgkin-Huxley巨型烏賊模型，作為經典的系統生物學的例子
7.3 Hodgkin-Huxeley模型的意義和他們的方法論
7.4 從神經科學的角度考慮線蟲的行為
7.5 Ferree和Lockery模型線上蟲趨化性中的套用
7.6 兩個範例為系統生物學提供的八則啟示
參考文獻
8 所有的模型都有缺陷
8.1 引言
8.2 建模和建模過程
8.3 解析建模
8.4 綜合建模
8.5 綜合建模VS.解析建模
8.6 動力學通路建模
8.7 所有的模型都有缺陷
致謝
參考文獻
9 沒有模型的數據與沒有數據的模型的融合
9.1 引言
9.2 本領域的基本情況
9.3 系統生物學的第一個根源：代謝和信號轉導途徑的模型
9.4 系統生物學的第二個根源：生物控制論和數學系統分析
9.5 系統生物學的第三個根源：“組學”
9.6 系統生物學的分支：不同根源的融合者
9.7 本領域的結構
9.8 關於自上而下的系統生物學的認識論和存在論問題
9.9 結論
參考文獻
第四篇 生物系統中的組織
10 一個自我合成的生物化學工廠：細胞體的系統生物學角度概述
10.1 如何成為一個系統生物學家
10.2 自我生成的細胞：細胞生物學中的關聯
10.3 物質系統的自主性：對特殊催化的需要
10.4 生命的裝配和邏輯
10.5 如何建立一個自我合成的工廠
10.6 生命系統的自我裝配
10.7 貢獻
致謝
參考文獻
11 生物體起源的系統生物學方法
11.1 引言
11.2 組織觀點
11.3 起點：非平凡的自我維持
11.4 NTSM組織和自主性
11.5 歷史一集合維度的出現
11.6 達爾文進化的開放結構
11.7 總結
致謝
參考文獻
12 生物學機制：用於維持自治的組織
12.1 引言
12.2 機制的基本概念
12.3 活力論者的挑戰
12.4 第一階段：Bernard，Cannon和控制論的關係
12.5 循環組織和Ganti的化學子(chemoton)
12.6 從Ganti的化學子到自治系統
12.7 結束語：超越基本自治
參考文獻
13 功能從“自組織系統”的消失
參考文獻
第五篇 結語
14 對系統生物學基礎的深入思考
14.1 系統生物學是功能和機制生物學，而不是進化生物學
14.2 系統生物學的解釋往往是機械論的解釋
14.3 其他解釋的類型對系統生物學來說也很重要
14.4 利用模型的分子機制描述
14.5 模型和生命系統的非平衡組織方式
14.6 湧現屬性
14.7 系統生物學中的理論和定理
14.8 解釋多元論：不同層次的理論
14.9 生命是什麼？
14.10 結束語
參考文獻
·收起全部<<
前言
系統生物學是近幾年產生和發展的一門新興學科。系統生物學最簡單通俗的定義就是在系統層次上理解生物的現象、功能和機制。它的目標是理解生物體的功能屬性與行為是如何通過其各組成部分的相互作用實現的。系統生物學是一門充滿活力並不斷發展的學科，它將生物學與其他眾多不同門類的學科相結合，並在套用這些學科的同時拓展和延伸它們，由此，系統生物學已經得出許多新的科學認識。可以說在一定的程度上系統生物學將會超越這些自然科學，因此，關於其哲學基礎本質的問題產生了。系統生物學的前提假設是，生物系統中存在著有待挖掘和發現的東西，也就是說，生命系統具有的一些功能屬性，單單通過傳統分子生物學是不能發現或理解的，因為這些功能屬性並不存在於單個分子之中，而是蘊藏於整個系統之中。
《系統生物學：哲學基礎（Systems Biology：Philosophical Foundations）》是現已出版的第一本有關係統生物學哲學基礎的著作，這本書以一個全新的視角來講述系統生物學，即通過討論構成系統生物學的哲學基礎來理解系統生物學的內涵和本質。對系統生物學的科學哲學進行深入的開放式討論，詳細闡明那些涉及系統生物學基礎的各種哲學問題，以及是什麼使得它與分子生物學如此之不同。作者在書中開展了許多富有啟發和成果性的討論，引導讀者思考系統生物學哲學的核心概念。這些對於系統生物學的學習和研究都是非常有益的。
本書的翻譯工作是清華大學生物科學與技術系生物信息學教育部重點實驗室師生集體共同完成的。參加本書翻譯校對工作的有蘇煜博士、周雲博士、陳虎博士、鐘山、夏雪峰、劉珂、張松、李碩、李文婷、張婷、羅潔等。全書由孫之榮教授主譯、審校。感謝科學出版社孫紅梅和李小汀兩位編輯為本書的出版所付出的努力。我們希望這本書的翻譯出版，可以促進讀者對這一新學科的學習和理解，並對系統生物學的科學研究及研究人才的培養提供良好的幫助和促進作用。
由於時間有限，對文中某些深奧的英文表達沒有作仔細的推敲，書中難免會有一些不確切的中文表達，懇請廣大讀者指正，以期再版時加以更正。
