《精神分裂症全基因組水平的生物信息學分析與驗證》是依託北京大學，由岳偉華擔任負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：精神分裂症全基因組水平的生物信息學分析與驗證
- 項目負責人：岳偉華
- 依託單位：北京大學
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
近年來精神分裂症(SCZ)全基因組關聯研究(GWAS)報導了多個疾病易感基因/位點，但各研究難以彼此驗證。本項目首先基於前期完成SCZ的GWAS數據與千人基因組計畫資料庫及國際SCZ的GWAS數據進行預測插補(imputation)後比對和meta分析，並通過生物通路及SKAT等分析方法，探索高度關聯易感基因/位點組合與疾病(內)表型組合的關聯；繼而在獨立的SCZ病例與對照樣本中，採用Sequenom檢測方法驗證meta分析發現的高度關聯易感基因及基因型-表型組合的對應關係；在SCZ核心家系中，採用MiSeq測序篩選出高度關聯染色體區的罕見變異，並進行外周血mRNA檢測和eQTL分析；最後在SCZ屍腦標本中進行易感基因的表達檢測及RNA-Seq分析，通過基因操作動物和細胞實驗研究易感基因的潛在功能。本項目預期結果為進一步發現SCZ高度關聯易感基因/位點(組合)並闡釋其發病機制提供線索。
結題摘要
項目組長期從事精神分裂症的遺傳易感性研究，並致力於建立數據平台規範，取得以下學術成績：(1) 採用全基因組關聯研究(GWAS)發現精神分裂症新易感基因，並開展東亞人群及亞歐跨種族精神分裂症易感基因的比較分析，進而初步解析易感基因的潛在神經生物學功能。(2) 套用多組學研究分析策略，發現精神分裂症轉錄水平異常機制，進而發現遺傳-環境風險因素的互動作用，通過大腦神經環路影響腦認知功能等高級功能。(3) 大樣本藥物基因組學研究發現與抗精神病藥療效及不良反應個體化差異關聯的新易感基因。(4) 建立精神障礙臨床研究科研協同平台和生物樣本庫系統。“精神疾病科研數據協同線上平台”的建設工作(http://www.h6world.cn/h6dp-web)，目前已完成了平台的框架構建工作和部分病例採集工作，並依託該項目進行了推廣套用。發表SCI收錄學術論著9篇，已修回3篇，相關內容未標註2篇；部分重要發現發表在Nat Genet, Lancet Psychiatry, Mol Psychiatry, Schizophr Bull, Sci Rep等雜誌，在國際上產生了重要的學術影響。申請國家發明專利2項及軟體著作權1項；與國內企業合作開發臨床檢測用藥物靶向檢測試劑盒一套，有較好的臨床轉化套用價值。
