程時鋒，研究員，博士生導師。國家自然科學基金委優秀青年科學基金獲得者，中國農業科學院"青年英才"，深圳市重大人才項目獲得者，2022年度陳嘉庚青年科學獎有效候選人。
程時鋒主要從事植物比較進化基因組學、作物群體遺傳學、和關鍵性狀起源和表型演化機制的多組學ENCODE研究。
基本介紹
工作經歷,教育經歷,研究方向,研究進展,
工作經歷
2018/10-至今 中國農業科學院農業基因組研究所 研究員
2011/07-2018/10 華大基因研究院 資深科學家
教育經歷
2013/09-2016/12 香港大學 博士研究生
2008/09-2011/07 深圳華大基因研究院 碩士研究生
2004/09-2008/07 湖北大學，生物科學 本科
研究方向
課題組關注植物生物多樣性基因組，聚焦於禾本科與豆科，以及背後兩個關鍵的科學問題：結瘤共生固氮與C4高光效的分子機制，並致力於從“phylogenomics”、“population genetics”和“trait-based ENCODE”三個維度進行系統研究。願景是學習大自然與進化的智慧並套用於農業與食品領域。主要研究方向包括：
1. 結瘤共生固氮演化起源與遺傳調控網路構建；
2. C4/CAM高光效性狀平行演化的分子機制;
3. 禾本科穀物與豆科豆類作物群體基因組及基因發現（G3RP： Global Grain Genomics Research Program）;
4. 水平基因轉移在植物（生命）起源與大進化中的關鍵角色。
研究進展
運用大規模比較系統發育基因組學技術分析結瘤固氮的祖先起源、分布和多樣性形成機制，首次提出"多重獨立丟失"學說，為結瘤固氮遺傳調控網路構建、結瘤固氮功能基因組學和將以豆科為代表的結瘤固氮性狀通過工程化手段移植到非豆科作物中奠定了堅實的理論基礎；通過基因組測序和生物信息學分析手段，研究禾本科、豆科等生物多樣性豐富的植物科屬及其代表性物種，探索其基因組進化歷史和祖先重構，關鍵基因家族演化史，非編碼區調控元件及關鍵遺傳代謝通路網路構建；積累大量有關真核生物的起源、陸地植物、植物、微生物symbiosis的起源等關鍵進化節化點上的基因組數據和發現。文章先後發表在 Science ， Cell ， Nature ， Nature ， Plant Cell ， Plant Journal 等知名學術刊物中。
中國農業科學院深圳農業基因組研究所程時鋒團隊與英國約翰·英納斯中心合作，引進了該中心保存的二十世紀初收集的來自世界30多個國家的小麥地方品種種質資源，開展了小麥群體全基因組變異圖譜構建、大規模的表型鑑定、遺傳作圖群體構建等工作，找到了現代小麥品種中丟失了的遺傳多樣性“寶庫”，包括控制小麥高產且抗倒伏新基因、氮高效利用新基因、籽粒鈣含量優質新基因等數千個有利遺傳變異位點。
