1900年8月唐才常在湖北發動自立軍起義,遭到清政府的絞殺。起義失敗後,以會黨為核心的民眾鬥爭在湖北地區此起彼伏地展開。此後,隨著拒法、拒俄運動的影響,湖北資產階級知識分子開始登上政治舞台。其中,一大批革命意志堅定的知識青年,在出外留學的熱潮之下,紛紛通過各種方式學習新知,遠洋海外。當時,留日的湖北學生革命情緒最為高漲,他們在東京出版了《湖北學生界》,宣傳革命。張繼、李書城等還各自撰寫《致國內同學書》,號召同學群起救國,湖北學界深受震動。
1904年春,兩湖革命志士劉靜庵、曹亞伯、胡瑛等齊集武昌,討論革命辦法。隨著張難先、胡瑛等革命志士的入伍,他們積極在新軍中展開革命宣傳,曉明革命要義,散發《革命軍》、《猛回頭》等革命書籍,使新軍深受觸動,革命傾向日益凸顯。此時,建立革命團體的各方麵條件均已成熟,他們也深感統一組織的急迫,1904年5月,張難先、胡瑛與朱元成等人,在武昌斗級營同慶酒樓集會,商議組織革命團體,並且推定呂大森起草章程,不久之後,呂大森擬定了章程,將團體取名為科學補習所,以補習研究科學為名,隱瞞官府,掩人耳目,機關設在武昌多寶寺街,以革命排滿為團體宗旨。章程草案經過胡瑛、朱元成等審查後,提交大會通過,科學補習所於6月正式成立,呂大森擔任所長,胡瑛任總幹事,宋教仁任文書。