福建師範大學福清分校馬克思主義學院是學校成立的直屬學校黨委領導的二級教學和管理機構，又是學校馬克思主義理論學科點的依託單位。
馬克思主義學院早期是學校的德育室，後改為思政課教研室掛靠經法系，2014年4月獨立設定成思政部,2017年4月成立馬克思主義學院，下設馬克思主義基本原理、中國近現代史綱要、毛澤東思想與中國特色社會主義理論體系概論、思想道德修養與法律基礎、形勢與政策等5個教研室和綜合辦公室。
馬克思主義學院主要承擔全校思想政治理論課的教學任務。面向本科層次開設的主要有公共課《馬克思主義基本原理》、《中國近現代史綱要》、《毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論》、《思想道德修養與法律基礎》、《形勢與政策教育》5門必修課和相關選修課程。
馬克思主義學院現有一支專兼職結合的經驗豐富開拓進取的教學、科研和學習團隊。
教學改革和管理方面，大膽探索新的教育教學模式，研究式、案例式、互動式、啟發式、討論式等教學模式受到學生普遍歡迎和參與，專題講授、討論、播放音像資料、講座、考察學習、社會調查等多種形式，不斷增強思想政治理論課教學的針對性、實效性。
近年來，思想政治理論課教育教學在師資建設、課程建設、教學研究、學科建設等方面取得較大進展。有校級教學名師1人，教壇新秀2人，青年學術骨幹1人。擁有1個省級教改團隊。擁有校級精品課程3門，獲省、校級優秀教學成果多項。出版專著教材10餘部，發表科研論文200餘篇，其中在《光明日報》、《中國教育報》、《紅旗文稿》、《人民論壇》、《思想理論教育導刊》等國家級、省部級以上學術核心期刊發表50餘篇，承擔省部級以上及校級教學科研課題60餘項，獲省社科優秀成果一等獎1項，獲全國高校思想政治教育學科優秀成果專著類三等獎1項。
