福建工程學院區域創新研究所為福建工程學院校級研究平台。近年來形成了較為穩定的研究團隊。平台至今承擔了多項省軟科學和福建省經濟發展與改革委員會、福建省科協等部門項目，多篇研究報告被相關政府部門採納。
福建工程學院區域創新研究所主要研究方向
科技創新制度體系研究：
該領域著力於通過科技創新制度的比較研究，把控區域創新制度的頂層設計，並對科技創新制度執行效果進行跟蹤評價，完善地方創新的制度體系環境。以福建省提出的新型研發機構作為制度研究的切入點，對新型研發機構政策進行跟蹤，並逐步完善相關政策。
科技創新成果轉化研究：
該領域將主要從科技成果轉化推進機制研究、科技成果轉化評價、 科技成果轉化協同模式研究、高校科技成果轉化研究、支持多階段科技轉化的資源匹配體系研究等。
科技創新金融政策研究：
該領域主要探討如何通過金融政策扶持促進科技創新，進而為福建省政府相關部門出台科技相關金融政策提供決策諮詢服務，並參與相關部門的政策制定過程中。
