祁門南站，設於安徽省祁門縣中心城區南面約3km，是南昌至景德鎮至黃山鐵路的一個擬設站點，車站中心裡程DK59+550，距離黟縣東站34.75km，距離瑤里站42.89km，為中間站性質車站，車站規模為2台4線。祁門南站所在地屬山前傾斜平原，車站南昌端咽喉位於橋上，車站黃山端跨越既有皖贛線。
祁門南站站房設於線位右側，車站設基本站台和中間站他各1座，規模均為450m×9m×1.25m，設到發線2條，按兩台夾四線布置，車站兩端各設渡線1組。車站對側設綜合維修車間1處（綜合維修車間負責全線基礎設施的維修和搶修工作），工區內設岔線4條，設定牽出線1條。
