白腐真菌降解多環芳烴過程中P450的表達譜及調控規律

《白腐真菌降解多環芳烴過程中P450的表達譜及調控規律》是依託清華大學,由寧大亮擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:白腐真菌降解多環芳烴過程中P450的表達譜及調控規律
  • 依託單位:清華大學
  • 項目負責人:寧大亮
  • 項目類別:青年科學基金項目
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

多環芳烴污染是亟待解決的重要環境問題;白腐真菌黃孢原毛平革菌是目前所知P450基因最豐富的微生物之一,其P450降解功能突出並受許多污染物的誘導,在多環芳烴等難降解有機污染的監測、治理乃至毒理學分析等方面均有突出的研究價值。但相關P450基因型不明、調控規律未知,極大制約了該真菌P450的研究與套用。本研究擬採用基因晶片技術,解析黃孢原毛平革菌降解菲過程中P450的基因表達譜,依據基因表達譜差異與P450活性的相關性篩選出與菲降解相關的P450基因;採用實時定量逆轉錄PCR技術,研究不同條件下相關P450基因表達水平的變化規律,並綜合P450活性的變化規律和基因表達譜分析的結果,揭示菲降解過程中P450的調控規律。本研究有利於深入理解和充分開發白腐真菌及其P450突出的降解功能,能夠為多環芳烴污染的監測和治理提供新的生物資源。

結題摘要

本課題採用白腐真菌模式菌種黃孢原毛平革菌,通過特徵產物分析、酶活檢測、基因晶片、高通量測序等技術,建立了該真菌P450對菲的特徵降解活性檢測方法,針對該真菌降解菲的過程,解析了關鍵降解酶系P450和MnP的活性變化規律、轉錄組功能基因多樣性及典型營養條件下基因表達譜的差異,並比較了萘、菲、芘三種典型多環芳烴誘導的P450基因表達譜。研究表明:(1)在營養豐富的原生代謝階段,主要由 P450催化菲的9,10位與3,4位加氧反應;進入營養受限的次生代謝階段後,P450逐步轉為僅催化菲的9,10位加氧反應,活性逐步下降,MnP催化菲的雙加氧反應,活性顯著增強並相對穩定,逐漸占主導。(2)該真菌降解菲的轉錄組共檢出10,048個基因,占預測基因總數的85%,表現出豐富的功能類型,其中包括142個P450基因。(3)營養豐富條件下,P450基因家族cyp5145A、5136A、5144A、5148A的部分基因在降解菲樣本中表達明顯上調,與此相應,與菲代謝過程可能相關的雙加氧酶、氧化還原蛋白、黃素蛋白合成酶以及lipA、lipD等46個基因表達顯著上調,而部分與碳代謝相關酶系乃至結構蛋白等85個基因表達顯著下調。營養限制條件下,P450基因cyp5163A3、cyp5152A2等在降解菲樣本中顯著上調,相應顯著上調的74個基因中不僅包括一些氧化酶及氧化還原蛋白的基因,還包括許多碳代謝功能基因,僅有19個基因明顯下調,其中包括mnpH1。該真菌僅有的1個P450氧化還原蛋白CPR在不同條件下均保持著較高的轉錄水平。營養條件表現出對包括P450在內的多類功能酶系基因表達顯著的調控作用。(4)P450轉錄調控與進化距離沒有明顯相關性。不同多環芳烴誘導的P450表達譜與多環芳烴的結構有一定相關性,並受培養條件的顯著影響。

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