指對序列庫中異常剪接mRNA的鑑定和分析。
基本介紹
- 中文名：異常剪接
- 定義：指對序列庫中異常剪接mRNA的鑑定和分析
- 隸屬領域：生物領域
- 主要功能：處理多順反子性轉錄單元，調控轉錄效率和mRNA的穩定性，同時可以增加產物蛋白的多樣性
本文設計了一套策略：來找出資料庫中存在的chromosome translocation、mRNA trans-splicing、multi-locus transcription、antisense transcription等異常剪接的mRNA 。
一方面自然潛在的這種異常剪接方式有重要的生物學作用。比如chromosome translocation可以下調某種基因的表達或者產生致癌基因，誘導癌細胞的生長選擇優勢；反式剪接的主要功能是處理多順反子性轉錄單元，調控轉錄效率和mRNA的穩定性，同時可以增加產物蛋白的多樣性。antisense transcription眾所周知有下調某基因表達的作用。所以鑑定出目前資料庫存在的這些異常剪接mRNA有重要的功能意義。
另一方面，由於試驗中的錯誤聯配和反向轉錄，會造成許多人為的異常剪接情況，比如嵌套基因、基因組污染等。這些序列必須從庫中遴選出改正或拋棄。
本文重要的借鑑意義在於它的策略流程：如下圖：
每一條過濾規則都有其意義，需深入理解
