細胞間的相互誘導作用並不單純由接觸引起,因為將誘導者去除,誘導現象並不消失,而使用誘導者提取物同樣可產生誘導效果。研究表明,胚胎誘導是通過信號分子介導的細胞間的信息傳遞實現的,即誘導者產生並釋放信號分子,這些信號分子被稱為生長及分化因子(growth and diferentiation factor)或旁分泌因子(paracrine factor)。
旁分泌因子被分泌到所誘導的細胞周圍,並以分泌這些因子的誘導組織為中心,由近至遠形成濃度梯度。旁分泌因子實際上是誘導性蛋白,與被誘導的細胞表面受體結合,將信號傳遞到細胞內,通過影響後者的基因表達誘導其分化。胚胎誘導普遍存在於脊椎動物的胚胎組織分化和器官形成過程中。在三個胚層中,中胚層首先獨立分化,並促進內、外胚層向相應的組織器官分化。