成書過程
生物信息學在中國國內不斷發展,其在本科教育領域的重要性逐漸凸顯,介紹和講授生物信息學的書籍也不斷出現,但是,由於編者的學科背景不同,各種專著的側重點和針對性也不盡相同,基於以上情況,該教材作者編寫了《生物信息學實驗教程》。
《生物信息學實驗教程》由呂巍、李濱任主編。
2016年2月1日,《生物信息學實驗教程》由高等教育出版社。
內容簡介
《生物信息學實驗教程》主要包括10個實驗,其中前6個實驗屬於基礎性實驗。實驗一介紹Linux作業系統,主要包括一些與生物信息學軟體使用相關的基本命令;實驗二介紹美國國家生物技術信息中心網站的相關套用方法;實驗三介紹如何通過網路來進行雙序列比對;實驗四介紹如何在本地伺服器通過BLAST程式進行序列比對和搜尋;實驗五介紹多序列比對的方法及使用;實驗六介紹進化分析方面的常用軟體,包括MEGA5.0和PHYLIP軟體包的使用方法;實驗七至實驗十屬於進階性實驗,主要介紹如何分析處理現階段生物學實驗所帶來的海量生物數據;實驗七和實驗八,分別介紹了轉錄組數據分析和基因組數據分析的常用軟體;實驗九介紹基因預測軟體,包括原核生物基因預測軟體Glimmer及真核生物基因預測軟體Genscan;實驗十簡要介紹蛋白質分析方面的實用工具。
教材目錄
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實驗二 美國國家生物技術信息中心(NCBI)網站的相關套用 |
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教學資源
《生物信息學實驗教程》配有Abook數字課程,該課程包括紙質教材中的全部插圖、教學視頻和教學課件等資源。
教材特色
1、《生物信息學實驗教程》從最基本的生物信息學相關的計算機的使用,到利用生物信息學方法去分析和探討一個實際的生物學問題。
2、《生物信息學實驗教程》中每個實驗中包括了當前流行和套用最廣的相關軟體(截至2015年10月),其中基礎部分適合本科生教學,而提高部分適合研究生教學。
作者簡介
李濱,男,教授,山東農業大學農業生物學實驗教學中心主任,