《生物信息學中的單體型推斷模型與算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由吳凌雲擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:生物信息學中的單體型推斷模型與算法研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:吳凌雲
- 依託單位:中國科學院數學與系統科學研究院
- 批准號:60503004
- 申請代碼:F0201
- 負責人職稱:研究員
- 研究期限:2006-01-01 至 2008-12-31
- 支持經費:21(萬元)
《生物信息學中的單體型推斷模型與算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由吳凌雲擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《生物信息學中的單體型推斷模型與算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由吳凌雲擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要由於單體型信息在遺傳學和醫學研究中的重要地位,單體型推斷方法引起了國際上眾多研究人員的重視...
而對最終計算結果沒有顯著影響。為了進一步加快單體型的重建,課題組為單體型組裝設計了基於top-k箇中間最優解的啟發式動態規划算法。項目促進了單體型計算模型及算法研究,項目的研究成果為生物信息學中大量複雜的計算問題的實用算法設計提供了新思路,也將促進單體型在複雜疾病全基因關聯分析中的套用。
本項目研究面向人群分類的基因組序列多態性分析方法,包括:研究基於圖模型的算法選擇標誌SNP位點;研究填補缺失位點信息、修正錯誤位點信息的單體型構建方法,確定群體單體型推導中長序列劃分準則,基於結構特徵確定家系單體型推導中的重組熱點,設計符合生物學實際特性的單體型劃分組合算法,提高單體分型的數據規模和準確程度;...
《生物信息學中的單體型推斷模型與算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由吳凌雲擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 由於單體型信息在遺傳學和醫學研究中的重要地位,單體型推斷方法引起了國際上眾多研究人員的重視。現有的單體型推斷方法大都不考慮發生重組(recombination)的因素,因而不適合於較長的...
研究方向 計算機算法與最佳化、生物信息學、智慧型最佳化算法 學術成果 主要研究項目 1.基於高通量多組學數據的癌症驅動通路識別算法研究,國家自然科學基金項目,編號:61762015,主持,2018-2021 2.基於新一代測序技術的K單體型組裝算法研究,國家自然科學基金項目,編號:61363035,主持,2014-2017 3.基於新一代測序技術的...
,"省科技攻關_垂直檢索系統的研究與開發",“教育部_科技論文網路發表平台的管理和可持續發展問題的研究”和“Web信息蒐集與智慧型分析系統”,並參與國家“現代服務業共性技術支撐體系與套用示範工程”重大項目- 子課題“數字社區服務示範工程”和山東省基金“針對生物信息學的單體型裝配問題的智慧型最佳化算法研究”等。
60.張瑞傑,郭政,李霞,基於基因表達譜分析的一種非參數得分算法及其界值確定方法,2002; 數理醫藥學雜誌 59.郭政, 李霞, 用仿真方法對用基因晶片檢測基因突變類型可行性的研究, 2002; 數理醫藥學雜誌 58.宮濱生, 李霞,郭政.SAGE系統簡介及套用,中國優生與遺傳學雜誌,2002 57.許傑,郭政,李霞.,通過表達譜區分基因...
(4)建立了蛋白質結構預測、單體型與基因型、加權網路的最佳化模型,構造了最佳化算法。經數值計算考核了模型與算法的正確性、提高了精度。3.2. 分片光滑非線性分布參數系統 (1) 針對分片光滑非線性分布參數系統的一種最優控制問題,套用區域分解,不可最佳化理論,集值映射等,使分解後的子系統具有充分光滑性,克服了...
覃春風,研究員,從事中醫學、植物大分子、分子生物學、生物信息學研究,對於基因檢測報告分析、幹細胞套用的風險評估、疾病易感基因分析經驗豐富,尤其在對癌症、心腦血管相關重疾患者的營養干預、理想蛋白質的套用作出了突破貢獻。人物生平 2001年,以特殊技能進入軍系醫療保健中心;2007年,參加“人類基因組單體型圖(...
13.5 利用擴展的系譜和祖先單體型進行精細定位 13.6 標準對數優勢比分析不是毫無問題的 進一步閱讀 參考文獻 第14章 鑑定人類致病基因 14.1 鑑定致病基因的原理和策略 14.2 不依賴定位的鑑定致病基因的策略 14.3 定位克隆 14.4 套用染色體畸變 14.5 確定候選基因 14.6 以8個例子闡明鑑定致病基因的各種方法 ...