生態菌斑假說（ecological plaque hypothesis）是目前齲病病因學的主流學說。該假說認為齲病是一種內源性感染性疾病，所有已發現的致齲菌都是口腔正常情況下存在的常駐菌群，齲病的發生是由於菌斑與宿主（如糖的攝入、唾液的分泌量以及牙齒的排列情況）之間的關係發生變化，常駐菌群中的某種或某些細菌獲得了競爭優勢或新的生物學特性，牙菌斑中微生物之間、牙菌斑與牙面及口腔環境之間的生態平衡被打破而造成的。生態菌斑假說是在對菌斑微生物較為全面認識的基礎上，以普遍聯繫和動態發展的視角詮釋齲病病因的理論成果。生態菌斑假說也為齲病的防治開闢了一條新的思路。
