《生命科學家的Python指南》是2020年科學出版社出版的圖書，作者是（美）亞歷山大·蘭卡斯特（Alexander Lancaster）,（美）戈登·韋伯斯特（Gordon Webster）。
基本介紹
- 中文名：生命科學家的Python指南
- 作者：（美）亞歷山大·蘭卡斯特（Alexander Lancaster）,（美）戈登·韋伯斯特（Gordon Webster）
- 出版社：科學出版社
- ISBN：9787030665980
內容簡介,圖書目錄,
內容簡介
本書對Python的計算機編程進行了生動活潑、直觀易懂且引人入勝的入門介紹。這本書是專門為沒有或幾乎沒有編程經驗的生命科學家而寫的，其目的不僅是為他們提供Python編程的基礎，而且是讓他們有信心和能力開始在自己的研究中使用Python。本書的所有示例均來自廣泛的生命科學研究領域，包括生物信息學、結構生物學、發育生物學、進化生物學和生態學，從簡單的生化計算和序列分析到對細胞中基因和蛋白質的動態相互作用，或對不斷發展的種群中的基因漂移進行建模。書中可以找到如何使用Python進行實驗室計算自動化、搜尋基因啟動子序列、旋轉分子鍵、構建細胞撥動開關、模擬動物皮毛形成的模式、生長虛擬植物、模擬流感流行或進化種群等實用的Python代碼寫成的完整的示例。
圖書目錄
- 緒論：歡迎來到尼迪亞王國
- 第1章Python入門：設定及使用Python
- 第2章實驗台上的Python：Python語言基礎
- 第3章理解序列：生物序列和Python的數據結構
- 第4章統計插值：貝葉斯定理與生物標記物
- 第5章打開數據之門：讀取、解析和處理生物數據檔案
- 第6章生物序列的搜尋：基因組和序列的正則表達式
- 第7章對象課程：生物序列作為Python的對象
- 第8章基因組數據的切片和分塊：下一代測序流程
- 第9章孔板：微量滴定板分析I——數據結構
- 第10章孔板的進一步探討：微量滴定板分析Ⅱ——自動化和可視化
- 第11章分子的3D表示：結構生物學的數學和線性代數
- 第12章打開和關閉基因：用matplotlib可視化生化動力學
- 第13章梳理網路偽信息：用Python集合挖掘系統生物學數據
- 第14章遺傳反饋循環：用Gillespie算法為基因網路建模
- 第15章種植虛擬花園：用L系統模擬植物生長
- 第16章細胞自動機：圖靈模式的細胞自動機模型
- 第17章生態動力學模型：捕食者－獵物動力學的生態建模
- 第18章虛擬流感流行：用基於代理的模型探索流行病學
- 第19章追尋生活的腳步：Wright－Fisher模型的進化動力學
- 後記：因為分手很難做到
