熊清(西南大學計算機與信息科學學院副教授)

研究方向：生物信息學、統計遺傳學、數據挖掘、Java套用系統開發2004年博士畢業於重慶大學生物醫學工程專業生物信息學方向，2005年進入西南大學計算機科學與技術系從事教學科研工作，2009年－2011年在美國杜克大學（Duke University）、2011-2012年在北卡大學教堂山分校（The University of North Carolina at Chapel Hill）從事博士後研究，在此期間的主要研究方向為生物信息學、統計遺傳學與Java套用系統開發。

現在的研究興趣與研究項目主要集中在以下幾個方面：

1、發展計算機/統計算法與軟體整合多種組學數據（基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組、表觀基因組等）解析疾病或其它複雜性狀的分子遺傳機制;

2、發展計算機/統計算法與軟體重建基因調控網路與調控網路與複雜性狀的關聯分析，解析複雜性狀的網路調控模式；

3、高通量基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組、表觀基因組數據的信息挖掘，鑑別有生物學意義的信息模式;

4、Java套用系統設計與實現。

現有的科研合作單位主要包括家蠶基因組生物學國家重點實驗室、北卡大學教堂山分校、杜克大學、西南大學心理學院與生命科學學院

近年科研代表作：

1, Xiong Q, Ancona N, Hauser ER, Mukherjee S, Furey TS. Integrating genetic and gene expression evidence into genome-wide association analysis of gene sets. Genome Research. 2012, 22(2) : 386-397

2, Xiong Q, Jiao Y, Hasty KA, Canale ST, Stuart JM, Beamer WG, Deng HW, Baylink D, Gu W. Quantitative trait loci, genes, and polymorphisms that regulate bone mineral density in mouse. Genomics. 2009, 93(5):401-414

3, Xiong Q, Qiu Y, Gu W. PGMapper: a web-based tool linking phenotype to genes. Bioinformatics. 2008, 24 (7):1011-1103

軟體開發代表作：

1、GSAA – Gene Set Association Analysis

2、PGMapper – Phenotype Genotype Mapper

3、智慧型化學習輔導系統、智慧型化課程設計系統、研究性協作學習系統。

熊清(西南大學計算機與信息科學學院副教授)

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