日美聯合反恐組織“防衛省中央調查部諜報2科分室”通稱CIRS(Central Intelligence and Research Second)在海上油井爆炸事件(《灰色的樂園》結局的希斯·奧斯陸事件)後因被公之於眾而重組為SORD(Social Ops,Research & Development)。以培育國防人才為目的的SORD與全國各地的學校展開合作。廢校後被閒置的“美濱學園”被個人所收購,成為了“特殊技能訓練校”。在這樣的校園中,因各種理由而失去了容身之地的少女們被授予了武器。以國防的名義,她們被派遣執行一個又一個危險的任務。“—— 我們被賦予在世界上的容身之處。但僅僅那樣是不夠的,躲在別人的背後活著毫無意義。所以,依靠自己的力量,為生存而戰鬥。只有倖存者才有活著的資格——“無論遭受何等苦難卻選擇拿起武器繼續戰鬥的少女們的未來是·····