據寺傳記載，
大同三年（808），
圓仁隨師
廣智赴
比睿山，途經此地時，感
不動明王之夢告，遂依夢告雕刻其像，並建一宇安置之。
承和十四年（847），
圓仁自唐返國後，復至此寺，當其獨鈷投於地時，清泉湧現，遂名此寺為瀧泉寺。
寬永元年（1624），
德川家光修造諸堂，並於本堂之東建遊獵用之御殿。寺中之建築物，現有本堂、山王鳥居、鐘樓、開山堂、愛染堂、大日堂、前不動堂、仁王門，及塔頭大圓寺、大聖院、成就院、壽福寺等。境內有青木昆陽墓及碑、西川春洞碑、野村宗十郎之胸像等。塔頭大圓寺並藏有西運之像及念佛鉦。又，本寺自古以本尊
不動明王而聞名，參詣者絡繹不絕。
