漠河市醫療保障局是漠河市機構改革新組建的政府工作部門。按照《漠河市機構改革方案》,將市人力資源和社會保障局的城鎮職工和城鎮居民基本醫療保險、生育保險、新型農村合作醫療職責,市經濟發展和改革局的藥品和醫療服務價格管理職責,市民政局的醫療救助職責等整合。