溴結構域

溴結構域(bromodomain)是一種能識別乙醯化賴氨酸殘基的蛋白結構域,例如組蛋白拖尾上N末端的賴氨酸殘基。這種識別是一些調節蛋白和組蛋白的結合以及染色質結構重塑的先決條件。溴結構域本身由4個α螺旋構成。

核小體組蛋白中賴氨酸的乙醯化被認為可以調節一些基因的轉錄。但是這個機制是什麼?學者們認為有兩種可能。一種是組蛋白的乙醯化可以疏鬆染色質中DNA和組蛋白的結合,從而使轉錄因子可以更容易地同基因中啟動子相關序列結合,從而達到調節相關基因轉錄的目的;另一種可能是調節蛋白可以直接識別組蛋白中乙醯化的賴氨酸,從而被乙醯化的組蛋白募集。而這個可以識別並結合乙醯化賴氨酸的蛋白基元,就是溴結構域。已經鑑定出大量含有溴結構域的調節蛋白。許多組蛋白乙醯化酶(histone acetyltransferase, HAT)本身有就含有溴結構域,比如CREBBP,p300,PCAF,GCN5和TAFII250.
雖然一些溴結構域蛋白的功能還未可知,但許多已被了解到在染色質結構重塑中扮演著重要角色,比如brm和brg1(哺乳動物中的兩種ATP依賴型水解酶,存在於染色質結構重塑複合物的核心)。值得注意的是一種溴結構域蛋白,BS69,在基因轉錄抑制複合物中起著重要的作用,這表組蛋白乙醯化可能含有多重的、不同的功能。我們可以清晰的想像出,在轉錄調控中,啟動子可以通過溴結構域蛋白判斷許多的關鍵的調節因子是否存在,從而決定相關基因的表達或者沉默。

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