湖州師範學院農村發展研究院是在市、校深入合作，全力服務新農村建設的背景下成立的，是對國家戰略，經濟社會發展和高等教育發展趨勢的順應和機遇的把握；有利於總結推廣浙江省湖州新農村建設的經驗，有利於發揮湖州師範學院的人才優勢。
湖州師範學院農村發展研究院實行2塊牌子、一套班子，合署辦公，為湖州師範學院正處級建制單位。於2013年6月7日舉行了農村發展研究院的成立授牌儀式，聘請中共湖州市委副書記金建新、湖州市政府副市長崔鳳軍為名譽院長。
湖州師範學院農村發展研究院要任務是：開展農村經濟、社會、文化研究；積極培育成果，建設高層次重點研究基地；為湖州地方農村發展提供決策諮詢與服務；開展國內外交流與合作。
湖州師範學院農村發展研究院機構設“一室三所”：辦公室，農業經濟研究所，農村社會發展研究所，農民問題研究所。
湖州師範學院農村發展研究院聘任浙江大學管理學院教授，博士生導師，國家現代農業產業技術體系（水稻）首席經濟學家，中國農業現代化（國家社科基金重大項目）首席專家，浙江省委講師團（兼職）經濟專家，浙江省農業軟科學委員會委員，知名“三農”研究專家楊萬江教授擔任首任院長。
湖州師範學院農村發展研究院以“專兼結合”的方式來進行隊伍建設。3名畢業於中國科學院等知名科研機構的博士擔任專職研究人員，進行專業研究。吸收校內外對“三農”研究感興趣的人員組建核心兼職研究人員，以課題為導向，定期開展學術沙龍，廣泛開展研究。成立學生“三農”社團，培養學生調研隊伍。
