湖南省森林病蟲害防治檢疫總站是湖南省林業廳內設機構。
主要職能：
1、宣傳貫徹執行國務院頒布的《植物檢疫條例》、《森林病蟲害防治條例》及其相關的法律法規，起草全省有關森林病蟲害防治監測和森林植物檢疫的配套政策、法規、規程、標準。
2、制定全省森林病蟲害監測防治和森林植物檢疫的長遠規劃和年度計畫，並組織實施。
3、組織全省森林病蟲害防治監測和森林植物檢疫業務的技術培訓和推廣。
4、依法管理和指導全省森林病蟲害防治、監測和植物檢疫工作，配合有關部門查處違反森林植物檢疫法規的行政案件。
5、指導地、縣森林植物檢疫機構建立無檢疫對象種苗繁育基地。
6、指導全省調運檢疫、產地檢疫工作；辦理本省從國外引進林木種子、苗木和其他繁殖材料的檢疫審批手續。
7、提出劃分或撤銷疫區和保護區的草案，組織審定和制定省內補充檢疫對象名錄。指導及協調檢疫對象疫區、發生區的封鎖、撲滅和檢疫工作。定期組織對全省危險性森林病蟲害的普查，並編制疫情報告。
8、制定全省主要森林病蟲害測報辦法，掌握全省主要森林病蟲害發生髮展趨勢，定期發布全省蟲情預報並報告上級主管部門。建立和健全全省監測網點及森林病蟲檔案。
9、負責全省林用農藥和藥械套用的監督和管理。
10、組織制定有關防止外來林業有害生物入侵的方針、政策、辦法，並監督執行。
11、組織制定防止外來林業有害生物入侵規劃和防治方案。
12、負責與有關部門在防止外來有害生物方面的協調與合作。
13、組織開展防止外來林業有害生物普查、國際交流與合作。
14、組織開展對外來林業有害生物的治理和風險評估工作。
15、承辦廳領導交辦的其它事項。
