渠鴻竹

渠鴻竹 ( QU Hongzhu )，副研究員，主要研究基因組學。

基本介紹

• 中文名：渠鴻竹
• 職稱：副研究員
• 任職單位：中國科學院北京基因組研究所
• 學位：博士

人物經歷

學習經歷

2000年9月-2004年7月 東北農業大學 生物技術專業 理學學士學位

2004年9月-2009年6月 中國科學院北京基因組研究所 基因組學專業 理學博士學位

工作經歷

2015年1月至今 中國科學院北京基因組研究所 副研究員

2009年10月-2012年9月 美國華盛頓大學基因組科學系 訪問學者

2009年7月-2014年12月 中國科學院北京基因組研究所 助理研究員

研究領域

幹細胞與疾病的組學與轉化醫學研究

科研項目

1.國家自然科學基金青年基金，FOXO3調控臍血幹細胞紅系分化的系統組學數據挖掘，在研，主持；

2.法醫遺傳學公安部重點實驗室開放性課題，DNA甲基化與年齡推斷模型建立與驗證評估，在研，主持；

3.諾和諾德與中科院聯合基金, Identify novel SLE targets using GWAS and ENCODE non-coding variants,結題，主持；

4.中科院人才項目，中國科學院青年創新促進會，在研，主持；

5.中科院知識創新工程青年人才領域前沿項目，基於DNase-Seq與ChIP-Seq等組學數據研究紅細胞分化的調控機制，結題，主持；

6.科技部973項目，腫瘤異質性的轉錄組和蛋白質組研究，在研，參加；

7.國家自然科學基金面上項目，轉錄因子KLFs調控幹細胞紅系分化的分子網路機制，在研，參加；

8.中國科學院戰略性科技先導專項子課題，利用高通量組學平台和系統生物學分析技術篩選腫瘤幹細胞的特異性標記物和治療靶點，在研，參加。

代表論著

1. Wang H, Li Y, Wang S, Zhang Q, Zheng J, Yang Y, Qi H, Qu H, Zhang Z, Liu F, Fang X*. Knockdown of transcription factor forkhead box O3 (FOXO3) suppresses erythroid differentiation in human cells and zebrafish

2. Yang Y, Dong X, Xie B, Ding N, Chen J, Li Y, Zhang Q, Qu H, Fang X*. Databases and Web Tools for Cancer Genomics Study. Genomics Proteomics & Bioinformatics

3. Yang Y, Wang H, Chang KH, Qu H, Zhang Z, Xiong Q, Qi H, Cui P, Lin Q, Ruan X, Yang Y, Li Y, Shu C, Li Q, Wakeland EK, Yan J, Hu S, Fang X*. Transcriptome dynamics during human erythroid differentiation and development

4. Chang KH, Huang A, Han H, Jiang Y, Fang X, Song CZ, Padilla S, Wang H, Qu H, Stamatoyannopoulos J, Li Q, Papayannopoulou T*. Transcriptional environment and chromatin architecture interplay dictates globin expression patterns of heterospecific hybrids derived from undifferentiated human embryonic stem cells or from their erythroid progeny

5. Xiong Q, Zhang Z, Chang KH, Qu H, Wang H, Qi H, Li Y, Ruan X, Yang Y, Yang Y, Li Y, Sandstrom R, Sabo PJ, Li Q, Stamatoyannopoulos G, Stamatoyannopoulos JA, Fang X*. Comprehensive characterization of erythroid-specific enhancers in the genomic regions of human Krüppel-like factors

6. Qu H, Fang X*. A brief review on the Human Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project. Genomics Proteomics & Bioinformatics

7. Wang H#, Maurano MT#, Qu H#, Varley KE, Gertz J, Pauli F, Lee K, Canfield T, Weaver M, Sandstrom R, Thurman RE, Kaul R, Myers RM, and Stamatoyannopoulos JA*. Widespread plasticity in CTCF occupancy linked to DNA methylation

8. Maurano MT#, Humbert R, Rynes E, Thurman RE, Haugen E, Wang H, Reynolds AP, Sandstrom R, Qu H, Brody J, Shafer A, Neri F, Lee K, Kutyavin T, Stehling-Sun S, Johnson AK, Canfield TK, Giste E, Diegel M, Bates D, Hansen RS, Neph S, Sabo PJ, Heimfeld S, Raubitschek A, Ziegler S, Cotsapas C, Sotoodehnia N, Glass I, Sunyaev SR, Kaul R, and Stamatoyannopoulos JA*. Systematic localization of common disease-associated variation in regulatory DNA

9. Thurman RE, Rynes E, Humbert R, Vierstra J, Maurano MT, Haugen E, Sheffield NC., Stergachis AB, Wang H, Vernot B, Garg K, John S, Sandstrom R, Bates D, Boatman L, Canfield TK, Diegel M, Dunn D, Ebersol AK, Frum T, Giste E, Johnson AK, Johnson EM, Kutyavin T, Lajoie B, Lee BK, Lee K, London D, Lotakis D, Neph S, Neri F, Nguyen ED, Qu H, Reynolds AP, Roach V, Safi A, Sanchez ME, Sanyal A, Shafer A, Simon JM, Song L, Vong S, Weaver M, Yan Y, Zhang Z, Zhang Z, Lenhard B, Tewari M, Dorschner MO, Hansen RS, Navas PA, Stamatoyannopoulos G, Iyer VR, Lieb JD, Sunyaev SR, Akey JM, Sabo PJ, Kaul R, Furey TS, Dekker J, Crawford GE, and Stamatoyannopoulos JA

10. ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature

11. Wu H, Qu H, Wan N, Zhang Z, Hu S, and Yu J*. Strand-biased gene distribution in bacteria is related to both horizontal gene transfer and strand-biased nucleotide composition

12. Qu H, Wu H, Zhang T, Zhang Z, Hu S, Yu J*. Nucleotide compositional asymmetry between the leading and lagging strands of eubacterial genomes

13. Song S, Huang Y, Wang X, Wei G, Qu H, Wang W, Ge X, Hu S, Liu G, Liang Y, Yu J*. HRGD: a database for mining potential heterosis-related genes in plants

14. Song S#, Qu H#, Chen C, Hu S, Yu J*. Differential gene expression in an elite hybrid rice cultivar (Oryza sativa, L) and its parental lines based on SAGE data

獲獎榮譽

2013年 2014年度中國科學院青年創新促進會會員