2018年5月19日-20日，深圳大學醫學部藥學院成立儀式在麒麟山莊舉行，會上由深圳大學副校長黎軍宣布在深圳大學醫學部藥學專業的基礎上成立藥學院，由廣東省藥理學會理事、深圳大學教授賀震旦擔任院長。
深圳大學藥學院以國家醫藥產業發展的需要為目標，致力於創立優勢學科，培養藥學人才，提高創製臨床新藥研發水平。藥學院依託深圳大學醫學部學科優勢，積極推動學科交叉，開創深圳大學藥學的創新發展之路。
藥學院現有藥學一級學科專業，已獲得藥學專業碩士學位授權一級學科點。設有藥理學、藥物化學、天然藥物學、藥物分析學、藥物製劑學、臨床藥學以及藥事管理學七個教研室。藥學院教職工擁有博士學位比例為86%，具有海外留學經歷教師為64%，在校學生210人。
藥學院現有醫學合成生物學套用關鍵技術國家地方聯合工程實驗室、廣東省天然小分子創新藥物工程技術研究中心、深圳市新型天然保健品研究重點實驗室等研究平台。研究領域涵蓋中藥及藥用植物物質基礎、藥材藥效學評價、抗腫瘤藥物、抗感染藥物、降血糖藥物、藥物設計與篩選、創新藥物關鍵技術等研發方向。承擔國家級項目30餘項，省部、市級項目多項，研究經費總額近億元，已在國際知名刊物發表研究性論文200多篇，與美國、德國、日本、英國、澳大利亞等國家的眾多高校建立了良好的合作關係，為藥學院的發展開拓了國際發展空間。
