淮安市洪澤區環保局成立於1989年,從原城鄉建設環境保護局分離出來,是政府組成部門,也是一個環境執法部門,內設5個科室。其中法規與宣教科主要負責國家、省、市環境保護的法律法規和方針政策的貫徹和執行以及環境保護宣傳教育工作;行政許可與總量服務科負責項目審批,從源頭上控制環境污染的總量和現有企業的減排;計畫科技與生態保護科負責環保中遠期規劃和生態創建工作;污染防治科負責環境污染治理的監督管理;辦公室負責統籌協調工作。下設2個事業單位,其中洪澤縣環境監察局負責環境現場監管和應急事故處理;洪澤縣環境監測站負責環境質量監測和信息發布。