浙江省水產種質資源高效利用技術研究重點實驗室於2012年9月浙江省科技廳立項建設，浙江萬里學院為承擔單位，寧波市海洋與漁業研究院為合作單位，2015年7月順利通過浙江省科技廳驗收。現有科研儀器設備資產總值3800萬元，實驗室面積4067m。實驗室主要研究方向：（1）水產養殖優良種質保存與保護；（2）水產養殖種質創新及良種培育；（3）水產養殖環境生物修復和病害控制。
浙江省水產種質資源高效利用技術研究重點實驗室現有研究人員45名，80 %以上具有高級職稱或博士學位。擁有國務院政府特殊津貼專家2名，浙江省萬人計畫人才1人，浙江省突出貢獻中青年專家1名，浙江省新世紀“151人才工程”5人，浙江省高校中青年學科帶頭人7人。
浙江省水產種質資源高效利用技術研究重點實驗室承擔了各類科研項目100餘項，科研經費達5500餘萬元。其中國家級項目27項（包含國家自然科學基金項目15項），省部級項目48項。培育出“萬里紅”、“萬里2號”文蛤新品種，獲得國家水產原良種審定委員會審定；“寧波岱衢族大黃魚農產品”獲得國家農業部“地理標誌登記證書”。作為第一完成單位獲得省部級以上科技獎4項。主編出版專著2本；在國內外重要學術刊物發表論文100餘篇，其中SCI收錄論文56篇；申請專利42項，授權25項，制定省市地方標準7項。
