1928年，國民黨甘肅省政府改卓尼土司衙門為洮岷路游擊司令部，楊積慶任司令，統轄三個支隊，分別由楊楹、楊錫齡、趙希云為支隊長。實際起作用的仍然是土司四十八旗的兵馬制度。1930年改游擊司令為保全司令。1937年楊復興襲父職，為十九任土司。1949年9月11日楊復興宣布起義，卓尼和平解放。於1950年11月1日被整編為中國人民解放軍甘肅省軍區卓尼民兵司令部。轄一個獨立營，編為3個連，共300多名士兵，直屬甘肅省軍區領導。1953年，劃歸甘南藏族自治區軍分區領導。1956年劃歸夏河軍分區領導。
