《沙門氏菌分子檢測特異性靶點的發掘與評價》是依託上海交通大學,由史賢明擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:沙門氏菌分子檢測特異性靶點的發掘與評價
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:史賢明
- 依託單位:上海交通大學
- 批准號:30771792
- 申請代碼:H3004
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2008-01-01 至 2010-12-31
- 支持經費:28(萬元)
項目摘要
採用公共資料庫中沙門氏菌(Salmonella)和其它微生物的基因組序列信息以及本課題組獲得的序列信息,利用以並行計算為核心的數據發掘平台,通過序列比對分析,發掘出了200個左右沙門氏菌基因組特異性片段。構建可視化微生物基因組自動注釋與分析系統,藉助此系統,在這些特異性片段中篩選出與沙門氏菌致病性相關的基因和調控元件,將上述特異性片段數縮小至50個左右,並針對這些候選檢測靶點,分別設計特異性引物,建立沙門氏菌PCR檢測方法。在此基礎上,同時與目前常用的檢測靶點進行對比分析,對候選靶點的特異性、靈敏度、抗干擾性和重複性進行評價,期望篩選出10個左右具有我國自主智慧財產權的沙門氏菌特異性檢測靶點,為沙門氏菌分子檢測和鑑定提供靶點資源,並為其它食源性致病菌分子檢測靶點的篩選提供新思路。