沈百榮

沈百榮

蘇州大學系統生物學研究中心主任, 特聘教授,博士生導師.

基本介紹

  • 中文名:沈百榮
  • 國籍:中國
  • 民族:漢族
  • 職業:教授
  • 畢業院校:復旦大學
  • 主要成就: 轉化醫學信息學
簡介,研究興趣,研究領域:,工作經歷,學術任職與學術組織活動,本科生和研究生教學,科研項目(2009~2013),研究論文,

簡介

蘇州大學系統生物學研究中心主任, 特聘教授,博士生導師
沈百榮
聯繫地址:
江蘇省蘇州市滄浪區蘇州大學老校區206信箱,郵編215006
蘇州大學系統生物學研究中心(校級研究機構)

研究興趣

整合生物醫學數據,通過模式識別和系統建模,尋找疾病診療的生物標誌物

研究領域:

複雜疾病的生物信息學與系統生物學研究
  • 高通量數據分析(下一代測序數據、醫學表型組學數據等)在癌症系統中的套用
  • 疾病相關的重要生物網路的系統生物學模擬
  • microRNA的生物信息學研究
  • 疾病相關蛋白質變異資料庫和蛋白質功能位點的分析
  • 基於組學和電子病歷的大數據研究,轉化醫學信息學

工作經歷

  • 2018年起任四川大學華西醫院醫學信息學博士生指導老師
  • 2008年夏任蘇州大學系統生物學中心特聘教授、主任,兼任蘇州大學生命科學院生物信息學系主任
  • 2005年起任同濟大學生命科學院生物信息學教授,博士生指導老師;
  • 2004年1月任芬蘭坦佩雷大學助理教授(生物信息學);
  • 2000年在芬蘭坦佩雷大學轉向生物信息學研究;
  • 1999年5月任復旦大學化學系副教授(物理化學)
  • 1997年畢業(博士)於復旦大學化學系:

學術任職與學術組織活動

主要學術兼職:1)中國運籌學會計算系統生物學分會:副理事長 ;2)中國生物化學與分子生物學會分子系統生物學專業委員會委員;3)中國細胞生物學學會功能基因組信息學與系統生物學分會委員;4)江蘇省醫學信息學會主任委員; 5) 美國系統生物學研究所兼職教授。
主要學術會議組織:1)國際轉化醫學信息學會議(International Conference on Translational Biomedical Informatics, ICTBI 2012, ICTBI2013,ICTBI2014等系列會議);2) 中美轉化醫學信息學研討會(Sino-US Translational Biomedical Informatics Workshop, SU-TBIW 2014等系列會議)

本科生和研究生教學

  • 統計力學(Statistical Mechanics,復旦大學,1997-1999)
  • R語言及其套用(R programming, University of Tampere,Finland 2004-2008)
  • 結構生物信息學(Structural Bioinformatics,University of Tampere,Finland 2004-2008)
  • 基因組信息學(Genome Informatics with Perl, 同濟大學 2006-2007)
  • 基因晶片數據分析(Microarray data analysis, University of Tampere,Finland 2004-2008)
  • 分子系統發生學(Phylogenetics, University of Tampere, 2004-2008)
  • 蛋白質組信息學(Proteome Informatics with R,同濟大學 2006-2009)
  • 系統生物學基礎與套用(Systems Biology, University of Tampere,Finland 2004-2008)
  • 計算生物學 (蘇州大學 2008~)
  • 免疫信息學與系統生物學 (蘇州大學 2008~) 等課程。

科研項目(2009~2013)

  • 疾病相關胺基酸變異與生物功能關係的模型建立、軟體開發與高通量計算分析(2009.1-2011.12, 國家自然科學基金)
  • 整合分析組學數據、尋找前列腺癌相關的microRNA調控模組(2011-2011,國家自然科學基金主任基金)
  • 前列腺癌相關生物模組和通路的資料庫構建及其功能分析 (2012-2015, 國家自然科學基金面上項目)
  • IL-1 a 在肝臟慢性炎症及腫瘤發生過程中的作用及其對機體免疫應答的影響(“非可控性炎症惡性轉化的調控網路及其分子機制”重大研究計畫培育項目,2011-2013)
  • 白血病相關生物網路模組和反應通路的資料庫構建與功能分析(2012-2014,高等學校博士學科點專項科研基金)
  • 微小RNA在若干重要器官發育中的網路調控機理及其功能(2007.1, 973計畫,負責微小RNA生物信息學與系統生物學)
  • 組織幹細胞的乾性維持、分化控制和免疫調節研究 (2010.1, 973計畫,負責生物信息學與系統生物學)
  • 系統生物學專業研究生跨學科培養模式的實踐與探索. (江蘇省2009年度研究生教育教學改革研究與實踐課題,重點課題)
  • 蛋白質生物功能位點的生物信息學預測:算法與軟體開發 (教育部留學人員回國基金, 2008)
  • 系統生物學模式的新型肝癌智慧型診療技術 (蘇州國際科技合作計畫, 2012)
  • 前列腺癌診斷、分級和預後相關的生物分子網路的構建和數學模擬(國家自然科學基金重大計畫,培育項目,2012 )
  • 醫療信息集成融合技術與系統開發(“十二五”國家高技術研究計畫<863計畫>生物和醫藥技術領域“數位化醫療工程技術開發”重大項目,前列腺癌組學和臨床數據融合,2013)

研究論文

參見Research-ID(E-6431-2012)
PUBMED 中的生物醫學論文

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