水豚亞科

水豚亞科（Hydrochoerinae）是豚鼠科下的一個亞科，其下所有屬中只有兩個還有存活物種，即水豚屬和岩豚鼠屬。不過在2005年之前，水豚和其親緣種還都分在水豚科下（Hydrochoeridae），後來基於生物系統發生學證據將其劃入亞科。但是一些古生物分類還依然採用舊的方法。其遠古近親的分類地位中所包含的生物數量已經大大減少。主要是水豚及其親緣動物的臼齒在不同種之間差異太大。例如曾經根據不同的臼齒劃出過四屬七種不同生物，但現在被認為它們只是不同年齡段的Cardiatherium paranense而已。