氣相色譜-質譜儀,是指將氣相色譜儀的高效分離能力與質譜儀獨特的選擇性、靈敏度、相對分子質量和分子結構鑑定能力相結合的儀器。其原理是多組分混合物經氣相色譜氣化、分離,各組分按保留時間順序依次進入質譜儀,各組分的氣體分子在離子源中被電離,生成不同質荷比的帶正電荷的離子,經加速電場的作用形成離子束,進入質量分析器後按質荷比的大小進行分離,最後由檢測器檢測離子束流轉變成的電信號,並被送入計算機內,這些信號經計算機處理後可以得到色譜圖、質譜圖及其他多種信息。組分的質量譜圖的分子離子峰、同位素峰和特徵碎片離子峰與該組分的分子結構有關,通過與標準質量譜圖庫的對比可對該組分定性並確定其結構。而組分的濃度與其質譜圖中基峰的離子流強度成正比,據此可對該組分進行定量分析。