《母血漿胎兒DNA甲基化標記的法醫學套用基礎研究》是依託中山大學，由歐雪玲擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：母血漿胎兒DNA甲基化標記的法醫學套用基礎研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：歐雪玲
- 依託單位：中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
如何建立無創性的方法進行胎兒親子鑑定是法醫學難題之一。表觀遺傳學研究提示DNA甲基化標記可能是解決這一難題的線索。課題組在青年基金項目資助下，利用晶片技術在全基因組範圍內篩選出144個含SNP的胎兒特異高甲基化DNA序列；預試驗選取其中3個候選序列（PSMB8、SKI及CHST11）進行驗證，證實其特異存在於孕婦血漿中，並與相應胎兒的SNP分型一致，提示在無創性胎兒親子鑑定研究中的良好潛力。本項目將採用重亞硫酸鹽處理結合高通量焦磷酸測序技術，對晶片篩選結果進行全面驗證，確定所有候選序列的甲基化模式；定量檢測通過驗證的候選序列在孕婦血漿中的特異性以及不同孕期血漿中的濃度；選取高特異性和高濃度的候選序列，使用質譜技術進行SNP分型，並與相應胎兒組織作一致性比較，觀察其揭示胎兒遺傳信息的準確性；基於以上實驗結果進行法醫學統計分析，評價其法醫學意義，為建立無創性胎兒親子鑑定方法提供可能的解決方案。
結題摘要
如何建立無創性的方法進行胎兒親子鑑定是法醫學難題之一。孕婦血漿游離胎兒DNA片段攜帶著整個胎兒染色體組的遺傳信息，被認為是實現無創產前親子鑑定的最理想胎兒檢材。採用目前常規的PCR-STR分型策略，由於受檢測靈敏度限制以及STR常見的影子峰等因素的影響，獲得的有效位點數目非常有限，且難以保證檢測結果的可重複性和準確性。新一代測序技術的發展，為游離胎兒DNA的法醫遺傳學研究提供了廣闊的前景。本項目基於第三代遺傳標記單核苷酸多態性（SNP）位點，分別使用Ion Torrent和Illumina兩大主流高通量測序平台，選擇短擴增子擴增和探針捕獲等兩種建庫方法對不同孕期的母血漿游離DNA開展了法醫遺傳學的研究，取得了以下重要研究結果： （1）通過資料庫篩選和實驗室驗證，在全基因組範圍內獲得一套足夠數量的、適於母血漿游離胎兒DNA法醫遺傳學分析的SNP新型遺傳標記。（2）基於高通量測序平台，建立適於胎兒游離DNA遺傳學分析的高信息量、高通量的檢測體系，其中包括微量母血漿游離胎兒DNA提取、文庫製備和高通量測序等技術環節。（3）根據結果制定相應的數據解析策略，構建無創胎兒親權鑑定的父權指數（PI）值算法；相關算法分別在由已知生物學父親或無關男性個體構成的真、假家系中進行驗證，並與常規STR分型方法作比較，系統評估其準確性和法庭科學有效性。本項目為建立精確、有效、適用於各孕期（特別是早孕期）的無創產前親子鑑定技術方法提供理論和套用基礎。具有重要的科學意義和套用價值。
