楊鵬，男，同濟大學生命科學與技術學院教授，國家青年特聘教授人才計畫入選者，國家重點研發青年首席科學家，中國遺傳學會表觀遺傳學會委員，中國細胞生物學學會染色質分會青年委員。長期從事早期胚胎/胎盤發育異常及胚胎幹細胞多能性的表觀遺傳機理研究。相關論文以第一作者或通訊作者發表在Science、Cell、Cell Research、Trends in Genetics、Stem Cells等期刊。
基本介紹
- 中文名：楊鵬
- 國籍：中國
- 出生地：內蒙古通遼市
- 出生日期：1983年
人物經歷,主講課程,研究方向,代表性論著,
人物經歷
教育經歷
2006南京大學 理學學士
2011北京大學 理學博士
工作經歷
2011-2012北京生命科學研究所
2012-2013美國霍華德休斯醫學研究所HHMI
2013-2017美國國立衛生研究院NIH
2018-今 同濟大學生命科學與技術學院
主講課程
研究生高級分子生物煮船挨格學
研究方向
早期胚胎髮育中細胞全能性的建立始於母源物質的消除及合子基因組的激活（Zygotic Genome Activation, ZGA）。逆轉座子作為合子中最早激活、比例最您企大的轉錄本，在 ZGA 完成後以異染色質化方整采鍵式被迅速失活，以保證細胞完成全能性向多能性的轉變及胚胎基因組的穩定。之前研究認為，鋅指蛋白在逆轉座子的轉錄調控中發揮重要作用。然而，作為哺乳動物中數目最大、進化速度最快的轉錄因子家族，鋅指蛋白在上述過程中的靶向調控位點、異染色質高級結構建立方式和生物學功能仍知之甚少。
占據人類基因組40%序列的逆轉座子在過去很長時間內一直被認為是基因組中的“垃圾序列”(Junk DNA)。然而最近的研究發現，這些來源於逆轉錄病毒的逆轉企幾肯凳座子不僅是基因組的重要組分，還可以通過不同方式對基因組產生重要影響。並且，在長期進化過程中，譽巴嫌其與宿主基因組中的鋅指蛋白形成了快速的共進化關係，通過一系列大分子複合物精密調控其中的相互作用。然而逆轉座子如何被轉錄調控的分子機理，以及不同鋅指蛋白的生物學功能一直比較模糊。為此本實驗室有以下幾個方向：
1.鋅指蛋白下游逆轉座子靶向作用序列，及相互作用鋅指蛋白間的調控網路
2.鋅指蛋白估定挨與印跡基因在胚胎髮育中的相互作笑霸員用關係及分子調控機制
3.鋅指蛋白與 CTCF 協同作用對染色質三維結構的影響
以上引自同濟大學生命科學與技術學院網站
代表性論著
Guo M, Zhang L, Zhou J, Bi Y, Xu J, Xu C, Kou X, Zhao Y, Li Y, Tu Z, Liu K, Lin J, Yang P*, Gao S*, Wang Y*. Procise temporal regulation of Dux is important for embryo development. Cell Res. 2019;DOI:10.1038/s41422-019-0238-4.[Epub ahead of print](*Corresponding Author)
Patel A*, Yang P*, Tinkham M, Sun M, Wang Y, Hoang D, Wolf G, Horton J, Zhang X, Macfarlan TS, Cheng X. DNA conformation induces adaptable binding by tandem zinc finger proteins. Cell 2018;173(1): 221-233 (*Equal Contribution)
Yang P, Wang Y, Hoang D, Tinkham M, Patel A, Sun M, Wolf G, Baker M, Lai N, Cheng X, Shen J, Macfarlan T. A placental growth factor is silenced in mouse embryos by the zinc finger protein ZFP568. Science 2017;356(6339): 757-759.
Yang P, Wang Y, Macfarlan T. The role of KRAB-ZFPs in retrotransposon repression and mammalian evolution. Trends in Genetics. 2017;33(11):871-881
Yang P, Wang Y, Chen J, Li H, Kang L, Zhang Y, Chen S, Zhu B, Gao S. Rcor2 is a Subunit of the LSD1 Complex that Regulates ES Cell Property and Substitutes for Sox2 in Reprogramming Somatic Cells to Pluripotency. Stem Cells 2011; 29(5):791-801.
Wang Y, Wu Q, Yang P, Wang C, Liu J, Ding W, Liu W, Bai Y, Yang Y, Wang H, Gao S, Wang X. LSD1 co-repressor Rcor2 orchestrates neurogenesis in the developing mouse brain. Nat Commun. 2016;7:10481
Wolf G, Yang P, Füchtbauer A, Füchtbauer E, Silva A, Park C, Wu W, Nielsen A, Pedersen F, Macfarlan TS. The KRAB zinc finger protein ZFP809 is required to initiate epigenetic silencing of endogenous retroviruses. Genes & Dev. 2015;29(5):538-54.
Yang P, Wu W, Macfarlan TS. Maternal histone variants and their chaperones promote paternal genome activation and boost somatic cell reprogramming. Bioessays. 2015;37(1):52-9.
以上引自Publons、Google Scholar和ORCID網站
Patel A*, Yang P*, Tinkham M, Sun M, Wang Y, Hoang D, Wolf G, Horton J, Zhang X, Macfarlan TS, Cheng X. DNA conformation induces adaptable binding by tandem zinc finger proteins. Cell 2018;173(1): 221-233 (*Equal Contribution)
Yang P, Wang Y, Hoang D, Tinkham M, Patel A, Sun M, Wolf G, Baker M, Lai N, Cheng X, Shen J, Macfarlan T. A placental growth factor is silenced in mouse embryos by the zinc finger protein ZFP568. Science 2017;356(6339): 757-759.
Yang P, Wang Y, Macfarlan T. The role of KRAB-ZFPs in retrotransposon repression and mammalian evolution. Trends in Genetics. 2017;33(11):871-881
Yang P, Wang Y, Chen J, Li H, Kang L, Zhang Y, Chen S, Zhu B, Gao S. Rcor2 is a Subunit of the LSD1 Complex that Regulates ES Cell Property and Substitutes for Sox2 in Reprogramming Somatic Cells to Pluripotency. Stem Cells 2011; 29(5):791-801.
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Yang P, Wu W, Macfarlan TS. Maternal histone variants and their chaperones promote paternal genome activation and boost somatic cell reprogramming. Bioessays. 2015;37(1):52-9.
以上引自Publons、Google Scholar和ORCID網站
