《植物檢疫性病菌DNA條形碼檢測技術研究與示範套用》是趙文軍、牟海青、張永江、高文娜、杜洪忠於2013年11月25日編制的科技報告。
基本介紹
- 中文名：植物檢疫性病菌DNA條形碼檢測技術研究與示範套用
- 作者：趙文軍、牟海青、張永江、高文娜、杜洪忠
- 編制時間：2013年11月25日
- 報告類型：進展報告
內容摘要
《植物檢疫性病菌DNA條形碼檢測技術研究與示範套用》（2012BAK11B02）課題2013年度總體研究目標為開展進境植物檢疫性真菌幾欠循、細菌、病毒及其近似種的DNA條形碼技術研究。墓殼肯凳主要內容包括檢疫性植物病原真菌、細菌、病毒菌種及其近似種的收集；DNA條形碼擴增引物的設計與篩選；植原體指紋圖譜鑑定系統的開發以及資料庫建立，同時，開發研製了檢疫性植物病原菌的分子生物學檢測鑑定方法。 目前，針對檢疫性植物病菌及近似種，已獲得4900條序列，780個憑證標本（DNA）,製備參考物質10種，發表文章5篇，申請專利3 項，研製標準3項，基本按照計畫進度開展。 （1）通過採集、交換及購買等多種方式進行檢疫性植物病原菌及近似種的收集，到目前為止，收集了課題所需要的大部分菌種，但還需要收集以擴充資料庫數據，並對不同來源的菌體腳種進行收集，確保數據的可靠性及鑑定結果的準確性。 （2）繼續開展檢疫性病原菌DNA條形碼技術研究及植原體指紋圖譜鑑定系統的研究。針對不同的屬的細菌、真菌、病毒等開展不同的鑑定用DNA條形碼的篩選與評價。利用基於16S rRNA基因的電子酶切指紋圖譜進行鑑定，目前已基本完成植原體資料庫及比對軟體，待最終測試完善後等待與條碼資料庫的對接。 （3）通過對目前所獲得的檢疫性的真菌及其近似種的ITS基因進行擴增和測序分析，利用ITS基因可以初步鑑定大部分檢疫性真菌。此外，僅通過ITS基埋宙妹因，某些真菌類群無法準確鑑定，例如：針對鐮刀菌屬的真菌可以利用EF-1α、RPB2和SSU基因三個基因進行聯合分析鑑定；對於疫霉屬真菌採用ITS基因、COI基因進行聯合分析鑑定；通過牛承閥對幾十株莖點霉屬真菌Phoma macdonaldii的ITS和Actin基因的測序比對分析研究發現，ITS與Actin基因的PCR 擴增與測序成功率高，在種內無差異，與屬內其他種煮船備盛類之間差異明顯，因此，是潛在DNA條碼基因。 （4）開展了基於條碼基因的恆溫擴增檢測方法，利用CPA技術，建立了番茄潰瘍病菌恆溫擴增檢測技術。利用試紙條對擴增產物進行檢測，整個過程需要1個小時，而且不需要複雜儀器，享匪盼接近於現場檢測。 （5）按照平台建設要求，繼續開展了病原菌相關生物學信息的查詢與收集，形成與病菌條碼配套的生物學信息數據。
