植物基因組學

《植物基因組學》是2020年科學出版社出版的圖書，作者是樊龍江。

基本介紹

• 書名：植物基因組學 
• 作者：樊龍江
• 出版社：科學出版社
• 出版時間：2020年4月
• 定價：88 元
• ISBN：9787030633132

內容簡介

本教材分為總論和各論兩篇，分別包括15章和10章。總論系統介紹了植物基因組學的基礎理論和方法，包括植物基因組測序拼接、轉錄修飾、進化選擇、育種利用，以及植物單細胞基因組、三維基因組和合成基因組等前沿研究，同時兼顧植物群體基因組和細胞器基因組等主題。總論提供了植物基因組的總體概貌和共性知識。各論著重介紹了代表性植物物種（如模式植物、重要農作物和進化起源相關植物）的基因組。各論展現了植物基因組的多樣性和異質性。

圖書目錄

第一篇 總論

第1-1章 緒論

第一節 基因組及基因組學概念

一、基因組基本概念

二、基因組學及其技術概述

三、基因組學發展簡史

第二節 植物基因組測序歷史與特徵

一、植物基因組測序歷史及其進展

二、植物基因組特徵

第三節 植物基因組學展望

一、植物基因組學研究路線圖

二、植物基因組學面臨的挑戰與展望

第1-2章 植物基因組測序與拼裝

第一節 基因組概貌調查

一、細胞遺傳學分析

二、基因組調查測序與K-mer分析

第二節 植物基因組測序

一、目前主要測序技術

二、植物基因組測序策略

第三節 植物基因組拼接組裝

一、基因組拼接

二、染色體水平組裝

第1-3章 植物基因組構成

第一節 植物基因組大小與基本結構

一、植物基因組大小

二、植物基因組基本結構

第二節 植物基因組主要構成因子

一、蛋白質編碼基因

二、非編碼基因

三、重複序列

第1-4章 植物基因組轉錄

第一節 植物基因組轉錄概述

一、轉錄組及其測定

二、基因轉錄水平分析

三、植物基因組轉錄調控

第二節 植物基因組轉錄特徵

一、植物轉錄本構成及其數量

二、蛋白質編碼基因轉錄水平與特徵

三、發育和環境脅迫下編碼基因轉錄變化

四、發育和環境脅迫下非編碼基因轉錄變化

第1-5章 植物基因組表觀遺傳修飾

第一節 植物基因組甲基化

一、DNA甲基化及其測定

二、植物發育與脅迫過程DNA甲基化變化

第二節 植物基因組印記

一、基因組印記概述

二、植物基因組印記研究舉例

第1-6章 植物基因組進化

第一節 植物基因組起源與複製

一、植物基因組起源與進化

二、基因組複製

第二節 基因組突變、重組與轉座

一、DNA突變與修復

二、同源重組

三、轉座

第三節 基因組多倍化

一、基因組片段倍增

二、基因組多倍化方式

三、基因組多倍化後二倍化過程

第四節 其他基因組進化機制

一、橫向基因轉移

二、B染色體

第1-7章 植物群體基因組

第一節 群體基因組學概述

一、群體基因組變異檢測

二、群體基因組進化分析方法

三、基因組選擇信號檢測方法

四、泛基因組分析

第二節 自然群體基因組特徵與自然選擇

一、自然群體基因組變異

二、群體起源和進化歷史

三、自然選擇位點及其特徵

第三節 作物群體基因組特徵與人工選擇

一、人工選擇對作物基因組的影響

二、作物群體結構

三、作物基因組人工選擇位點

四、遺傳漸滲與環境適應

五、作物泛基因組

第1-8章 植物單細胞基因組

第一節 單細胞基因組學概述

一、單細胞及其基因組研究歷史

二、單細胞基因組學關鍵技術

第二節 植物單細胞基因組研究

一、植物單細胞基因組研究案例

二、植物單細胞基因組學展望

第1-9章 植物三維基因組

第一節 三維（3D）基因組學概述

一、三維基因組及其分析技術

二、三維基因組學套用領域

第二節 植物三維基因組研究

一、基於三維構象的植物基因組組裝

二、植物基因組三維構象與調控元件特徵

第1-10章 植物合成基因組

第一節 合成生物學概述

一、合成生物學概念及其技術

二、植物合成基因組意義與展望

第二節 植物基因組設計與合成

一、植物次生代謝途徑人工合成

二、光合途徑與高光效植物創製

三、植物底盤基因組

第1-11章 葉綠體基因組

第一節 葉綠體基因組概述

一、葉綠體及其基因組測序進展

二、葉綠體基因組結構與轉錄

第二節 葉綠體基因組特徵與利用

一、葉綠體基因組進化緩慢

二、葉綠體基因組橫向轉移

三、葉綠體基因組利用

第1-12章 植物線粒體基因組

第一節 植物線粒體基因組概述

一、植物線粒體及其基因組測序進展

二、植物線粒體基因組結構

第二節 植物線粒體基因組特徵與利用

一、線粒體基因組大小跨度大

二、動植物線粒體基因組存在明顯差異

三、RNA編輯

四、植物線粒體基因組利用

第1-13章 植物功能基因組學

第一節 功能基因定位與關聯

一、數量性狀基因座定位

二、全基因組關聯分析

三、混池分離分析

第二節 突變體創製與分析

一、理化誘變

二、插入突變

第三節 基因功能分析技術

一、基因編輯

二、RNA干擾

三、植物表型組學技術

第1-14章 組學數據育種利用

第一節 組學數據與作物育種

一、作物育種過程及其遺傳本質

二、作物組學數據育種利用途徑

第二節 作物育種選擇的基因組學解析

一、遺傳重組率圖譜

二、作物遺傳傳遞及其變異

三、雜種優勢

第三節 組學相關育種技術

一、基因組選擇

二、大數據技術及其育種利用

第1-15章 植物基因組數據資源

第一節 綜合性基因組數據資源

一、國際公共基因組資料庫

二、植物綜合性基因組資料庫

第二節 植物轉錄與修飾相關數據資源

一、植物轉錄相關資料庫

二、植物表觀遺傳修飾相關資料庫

第二篇 各論

第2-1章 擬南芥基因組

第一節 擬南芥基因組概況

一、擬南芥及其系統發生關係

二、基因組測序歷史與進展

三、基因組基本構成及其資料庫

第二節 擬南芥基因組特徵與進化

一、首個植物基因組倍增證據

二、植物模式基因組構成

三、植物自然群體基因組變異

第三節 擬南芥基因組轉錄與功能

一、擬南芥基因組轉錄與修飾

二、擬南芥功能基因及其基因組分布

第2-2章 水稻基因組

第一節 水稻基因組概況

一、稻屬系統發生關係與基因組大小

二、基因組測序歷史與進展

三、基因組基本構成及其資料庫

第二節 水稻基因組特徵與進化

一、古老多倍體

二、基因組提供秈稻與粳稻馴化起源的證據

三、栽培稻可能發生去馴化過程

第三節 水稻基因組轉錄與功能

一、基因組轉錄與修飾

二、重要農藝性狀功能基因位點

第2-3章 玉米基因組

第一節 玉米基因組概況

一、玉蜀黍屬系統發生及其基因組測序進展

二、基因組基本構成及其資料庫

第二節 玉米基因組進化與功能

一、基因組特徵與進化

二、基因組轉錄與功能

第2-4章 小麥基因組

第一節 小麥基因組概況

一、小麥系統發生及其基因組測序情況

二、普通小麥基因組基本構成及其資料庫

第二節 小麥基因組進化與功能

一、基因組特徵與進化

二、基因組轉錄與功能

第2-5章 大豆基因組

第一節 大豆基因組概況

一、大豆系統發生及其基因組測序情況

二、基因組基本構成及其資料庫

第二節 大豆基因組進化與功能

一、基因組特徵與進化

二、基因組轉錄與功能

第2-6章 棉花基因組

第一節 棉花基因組概況

一、棉屬系統發生及其基因組測序進展

二、棉花基因組基本構成及其資料庫

第二節 棉花基因組進化與功能

一、基因組特徵與進化

二、基因組轉錄與功能

第2-7章 油菜基因組

第一節 油菜基因組概況

一、油菜基因組大小及其測序進展

二、油菜基因組基本構成及其資料庫

第二節 油菜基因組進化與功能

一、甘藍型油菜基因組特徵與進化

二、基因組轉錄與修飾

三、功能基因基因組關聯分析

第2-8章 蔬菜基因組

第一節 蔬菜基因組概述

一、蔬菜主要種類及其基因組測序情況

二、蔬菜基因組特徵與進化

第二節 蔬菜基因組功能與利用

一、番茄果實發育相關功能基因

二、蔬菜瓜果風味功能基因

第2-9章 林果花卉基因組

第一節 林果花卉基因組概述

一、主要林果花卉種類及基因組大小

二、林果花卉基因組測序概況

三、林果花卉基因組特徵與進化

第二節 林果花卉基因組功能與利用

一、風味和營養形成相關功能基因

二、花卉觀賞性狀相關基因

三、其他重要性狀基因位點鑑定

第2-10章 非維管束植物基因組

第一節 綠藻基因組

一、綠藻基因組概述

二、綠藻基因組特徵及其進化

第二節 輪藻基因組

一、輪藻系統發生關係及其基因組

二、陸地植物遺產基因

第三節 苔蘚類植物

一、苔類基因組

二、蘚類基因組

主要參考文獻

附錄1 植物基因組測序物種清單

附錄2 主要中英文術語釋義