柔性印刷機的各印刷色組互相獨立且呈水平直線排列，機組之間可用一根共用的傳動軸來驅動印刷單元，也可由各機組的獨立傳動系統驅動印刷單元。
機組排列方式,層疊式,機組式,衛星式,
機組排列方式
機組式
衛星式
層疊式
層疊式柔性版印刷機的各印刷色組上下層疊，排列在印刷部件主牆板的一側或兩側，每一個印刷色組通過裝在主牆板上的齒輪傳動。印刷時，承印物依次通過各印刷組，完成全部印刷。每一個印刷色組都有壓印滾筒、印版滾筒和輸墨裝置，而且各印刷色組結構相同。層疊式柔性版印刷機可印刷1到8色，但多為6色，若配置有翻轉裝置，還可以進行正、反面印刷。其結構如下圖2所示。
機組式
機組式柔性版印刷機的各印刷色組互相獨立且呈水平直線排列，機組之間可用一根共用的傳動軸來驅動印刷單元，也可由各機組的獨立傳動系統驅動印刷單元。
印刷時，承印物沿水平方向前進，依次完成各色印刷，基本結構如圖3所示。這種機型可進行單色、多色、單雙面多色印刷。
圖3衛星式
衛星式柔性版印刷機所有的印刷單元共用一個印刷滾筒，即只有一個大的中央壓印滾筒，各個印刷滾筒圍繞著這個大直徑的壓印滾筒轉動。在承印物進入印刷滾筒和壓印滾筒之間，緊貼著壓印滾筒的表面轉動一圈後，依次完成多色印刷。其基本結構如下圖4所示。
圖4