染色質免疫共沉澱法

染色質免疫共沉澱法是在保持組蛋白和DNA聯合的同時，通過運用對應於一個特定組蛋白標記的生物抗體，染色質被切成很小的片斷，並沉澱下來。這項技術主要用來分析目標基因有沒有活性、或者分析一種已知蛋白(轉錄因子)的靶基因有哪些。真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在。

CHIP不僅可以檢測體內反式因子與DNA的動態作用，還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的關係。而且，CHIP與其他方法的結合，擴大了其套用範圍：CHIP與基因晶片相結合建立的CHIP-on-chip方法已廣泛用於特定反式因子靶基因的高通量篩選；CHIP與體內足跡法相結合，用於尋找反式因子的體內結合位點；RNA-CHIP用於研究RNA在基因表達調控中的作用。